[发明专利]从二代测序数据挖掘植物ITSs序列并用于鉴别品种家系有效
申请号: | 202110640825.X | 申请日: | 2021-06-09 |
公开(公告)号: | CN113160893B | 公开(公告)日: | 2022-08-19 |
发明(设计)人: | 胡金勇;崔卫华;蒋晓东;仲米财;董雪;方伟;锁志全 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明植物研究所 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B30/20;G16B40/20;C12Q1/6895 |
代理公司: | 郑州亦鼎知识产权代理事务所(普通合伙) 41188 | 代理人: | 张夏谦 |
地址: | 650201 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | 本发明提供了一种通过二代测序数据准确组装个体内ITS不同单倍型的方法,包含以下步骤:1)制备待测样本总DNA的二代测序文库;2)将所述二代测序文库进行测序,得到测序数据;3)将所述测序数据分别进行ITS1、ITS2序列拼接和注释。本发明还公开了该方法组装得到的ITSs序列。本发明还提供了进一步的应用,包括使用该ITSs序列及对应的叶绿体基因组序列作为指纹鉴别样本的家系。对食用玫瑰,本专利能够直观的判断食用玫瑰品种的双亲来源及食用玫瑰品种之间的遗传关系,不仅能够准确快速鉴定品种及家系,还能为待测品种的育种途径和可能的改良方向提供重要的指导信息。 | ||
搜索关键词: | 二代 序数 挖掘 植物 itss 序列 用于 鉴别 品种 家系 | ||
【主权项】:
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