[发明专利]用于前列腺癌分类的标志物基因

权利要求书

1.一种对受试者中的前列腺癌进行分类的方法，所述方法包括：

a)确定基因F3和IGFBP3在来自所述受试者的样品中的基因表达水平；

b)通过将a)中所确定的基因表达水平与在已知分别患有高风险或低风险肿瘤的参考患者中相同基因的参考基因表达比较对所述肿瘤进行分类；以及

c)如果a)中确定的基因表达水平与患有高风险肿瘤的参考患者的参考基因表达匹配，则推断所述受试者中的肿瘤是高风险肿瘤，并且如果在a)中确定的基因表达水平与患有低风险肿瘤的参考患者的参考基因表达匹配，则推断所述受试者中的肿瘤是低风险肿瘤。

2.如权利要求1所述的方法，其中a)还包括确定基因VGLL3和c-MAF中的一个或多个，优选VGLL3的基因表达水平。

3.如权利要求1-2所述的方法，其中a)还包括确定基因WNT5B和CTGF、EZH2、AMACR和MUC1中的一个或多个的基因表达水平。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述基因表达水平通过对由所述基因表达的RNA或mRNA的量进行定量来确定。

5.如权利要求4所述的方法，其中所述RNA或mRNA的量通过使用选自以下的方法来确定：微阵列技术、RNA印迹和定量PCR(qPCR)，诸如实时定量PCR(qrt-PCR)，任选地多重PCR。

6.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述基因表达水平通过对由所述基因编码的蛋白的量进行定量来确定。

7.如权利要求6所述的方法，其中所述蛋白的量通过使用选自以下的方法来确定：免疫组织化学、蛋白质印迹、ELISA、RIA和质谱法。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述样品是获自所述受试者的肿瘤样品。

9.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述样品是获自所述受试者的血液样品。

10.一种用于确定诊断为前列腺癌并患有肿瘤的受试者的预后的方法，所述方法包括

a)使用根据权利要求1-9中任一项所述的方法对所述肿瘤进行分类；以及

b)推断，低风险肿瘤指示所述受试者具有良好预后，而高风险指示所述受试者具有不良预后。

11.如权利要求10所述的方法，其中所述不良预后为与所述良好预后相比生存可能性的降低。

12.如权利要求10所述的方法，其中所述不良预后为与所述良好预后相比总生存时间的减少。

13.如权利要求10所述的方法，其中所述不良预后牵涉与所述良好预后相比癌症特异性生存时间的减少。

14.如权利要求10所述的方法，其中所述不良预后牵涉与所述良好预后相比增加的死亡风险。

15.一种为诊断为前列腺癌并患有肿瘤的受试者制定治疗决策的方法，所述方法包括

a)使用根据权利要求1-9中任一项所述的方法对所述肿瘤进行分类；以及

b)根据在a)中获得的分类为所述受试者制定治疗决策。

16.如权利要求15所述的方法，其中对于患有局限性癌症和高风险肿瘤的患者，所述治疗决策是给予根治性治疗或治愈性治疗。

17.如权利要求15所述的方法，其中对于患有局限性癌症和低风险肿瘤的患者，所述治疗决策是等待治疗或给予激素疗法，诸如阉割疗法或抗雄激素疗法。

18.如权利要求15所述的方法，其中对于患有晚期癌症和高风险肿瘤的患者，所述治疗决策是给予化疗。

19.如权利要求15所述的方法，其中对于患有晚期癌症和低风险肿瘤的患者，所述治疗决策是给予阉割疗法。

20.一种治疗诊断为前列腺癌并患有肿瘤的受试者的方法，所述方法包括

a)使用根据权利要求15-19中任一项所述的方法制定治疗决策；以及

b)根据所述治疗决策治疗所述受试者。

21.基因F3和IGFBP3以及任选地，VGLL3和c-MAF中的任一个，或由其编码的蛋白作为用于前列腺癌的预后标志物的用途。