[发明专利]通过N端增加二硫键提高米曲霉木聚糖酶热稳定性的方法无效
申请号: | 201210562539.7 | 申请日: | 2012-12-24 |
公开(公告)号: | CN102978223A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
发明(设计)人: | 邬敏辰;陈忠法;胡蝶;李剑芳 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N15/81;C12N1/19;C12N9/42;C12R1/84 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 增加 二硫键 提高 曲霉 聚糖 热稳定性 方法 | ||
1.一种源自米曲霉(Aspergillus oryzae)CICC 40186、归属于糖苷水解酶第11家族的常温木聚糖酶基因Aoxyn11A,以另一个同家族的超耐热木聚糖酶基因Syxyn11(GenBank accession NO.JX459567)模板,利用计算机技术及其相关软件,结合分子动力学模拟的方法,对AoXyn11A分子进行理性设计,定向改造以提高热稳定性。
2.利用分子动力学模拟的方法理性设计热稳定性提高的杂合基因:
(1)同源建模模拟AoXyn11A的空间结构:登录蛋白质结构数据库Protein data bank(http://rcsb.org),经BLAST比对,找到与AoXyn11A具有高度同源的序列;本实验选择热稳定非常高的EvXyn11TS(Protein Data Bank登录号为2VUL)为模板,并且两者的同源性为66.49%,运用SWISS-MODEL服务器在线全自动为A.oryzae常温木聚糖酶成熟肽构建空间结构;运用软件Verify_3D对同源建模的结构模型进行评估和优化,获得准确性较高的空间结构模型;
(2)利用分子动力学模拟的方法理性设计热稳定性提高的杂合基因:通过序列比较,我们把EvXyn11TS前面5个氨基酸(NAQTC)添加到AoXyn11A的N端,再把杂合酶的32位T改为C,然后我们以EvXyn11TS为模板,对杂合木聚糖酶进行同源建模,再运用分子动力学模拟方法分别对杂合酶和原酶进行总体能量及RMSD值计算,由结果我们得出杂合酶的总体能量和RMSD值相对于原酶而言较小,即热稳定性较好。
3.杂合木聚糖酶工程菌的构建和表达方法:
(1)杂合基因Aoxyn11A1表达质粒的构建:根据GenBank上Aoxyn11A基因序列(GenBank accessionNo.JQ326257)设计3个引物:
Xyn11-F:5’-CTCGAGAAAAGAAACGCTCAAACTTGTTCCACACCCAGTAGCACGG-3’,含有XhoI酶切位点
Xyn11-Rm:5’-GTATGAACCGCCGTTGCCGTTACAGTAAGTCACATCAC-3’
Xyn11-R:5’-GCGGCCGCTCAATAAACAGTGATAGCAG-3’,含有Not I酶切位点
采用大引物PCR技术对原基因进行定向诱变,主要分为三步:以原基因质粒为模板,采用引物Xyn11-F和Xyn11-Rm,进行PCR首轮扩增(94℃5min;94℃30s,55℃30s,72℃30s,30个循环;72℃10min);对该PCR产物核酸电泳并进行割胶回收,回收产物作为N端引物,C端引物为Xyn11-R,进行第二轮PCR扩增(94℃5min;94℃30s,45℃30s,72℃60s;72℃延伸10min);将第二轮PCR目的条带进行克隆、测序;测序正确的pUCm-T-Aoxyn11A1与载体pPIC9KM(已申请专利,专利号201110410391.0)质粒均用Xho I和Not I进行双酶切,回收的酶切产物在T4DNA连接酶的作用下进行连接,得到重组质粒pPIC9KM-Aoxyn11A1,并对重组表达质粒进行序列测定;
(2)GS115/Aoxyn11A1重组子的构建、表达及酶活的测定:用Sac I对pPIC9KM-Aoxyn11A1进行线性化,按照毕赤酵母表达手册进行电转化、筛选,得到高拷贝的毕赤酵母重组子GS115/Aoxyn11A1;该工程菌用1.0%甲醇诱导96h,离心上清液为重组木聚糖酶粗酶液,对该酶和原酶的酶学性质进行比较:在0.5%的榉木木聚糖底物、反应时间为10min的情况下,AoXyn11A1的最适温度由原酶的55℃提高为58℃;55℃预热下,AoXyn11A1的半衰期由原酶的~4min升到~28min。
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