[发明专利]一种提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法无效
| 申请号: | 200810010349.8 | 申请日: | 2008-02-03 |
| 公开(公告)号: | CN101230342A | 公开(公告)日: | 2008-07-30 |
| 发明(设计)人: | 史荣久;莫旭华;徐慧;杨伟超;张颖 | 申请(专利权)人: | 中国科学院沈阳应用生态研究所 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 | 代理人: | 许宗富;周秀梅 |
| 地址: | 110016辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 提高 dna 质量 土壤 样品 提取 方法 | ||
1.一种提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:
1)向0.5-5.0g提取样品中加入1.0-5.5ml DNA提取缓冲液,再加入0.3-1.0g石英砂和5-50μl浓度为的蛋白酶K并混匀,置于漩涡振荡器中震荡10~20min;然后30-40℃水浴1-2小时;其中DNA提取缓冲液为50-150mM Tris-HCl,50-100mM EDTA,50-100mM磷酸盐缓冲液,0.5-2.5MNaCl,质量浓度为0.5-2%十六烷基三甲基溴化铵;
2)将震荡后反应液中加入200-2000μl质量浓度为5-10%的十二烷基磺酸钠漩涡震荡后反复冻融3次,而后放入65℃水浴中温育1-2h,进而在室温条件下6000-10000×g离心10-30min,收集上清液,备用;
3)在上述上清液中加入等体积的苯酚-氯仿-异戊醇混合液,摇匀至乳状,室温条件下6000-10000×g离心10-30min,收集上清液;而后再上清液中加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,混匀至乳状,室温条件下6000-10000×g离心10-30min,收集上清液;
4)将上述上清液中加入其0.2-0.3倍体积的醋酸钠和0.8-1.2倍体积冷异丙醇混匀,在4℃放置1-2h,10000-12000×g离心20-30min,收集DNA沉淀,沉淀经乙醇润洗2-3次,而后干燥;
5)向干燥后的DNA沉淀中加入50-100μL TE缓冲液使其溶解,得到DNA粗提液;
6)将上述粗体液中500-1000μL的DNA提取缓冲液,重复步骤3)-5)即可获得较高质量的DNA提取液。
2.按权利要求1所述的提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:所述步骤1)水浴过程中每隔5-15min将样品上下翻转混匀;所述蛋白酶K浓度为10-20mg/L。
3.按权利要求1所述的提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:所述经步骤2)离心所得沉淀中加入DNA提取缓冲液100-600μl,SDS溶液40-400μl,漩涡震荡混匀,放入65℃水浴中温育30-60min,室温条件下6000-10000×g离心10-30min,收集上清液,其上清液与步骤2)中获得的上清液混合,备用。
4.按权利要求1所述的提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:所述步骤2)反复冻融为在-65℃冷冻而后在65℃速融即为一次,同时在-65℃冷冻时间为30-60min,65℃时融化时间为10-20min。
5.按权利要求1所述的提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:所述TE缓冲液为5-20mM Tris-HCl,pH7.5-8.0,0.5-2mM EDTA,所述DNA提取缓冲液中Tris-HCl pH为7.5-8.0,EDTA pH为7.5-8.0,磷酸盐缓冲液pH为7.5-8.0。
6.按权利要求1所述的提高DNA质量的土壤样品总DNA提取方法,其特征在于:所述步骤3)中苯酚-氯仿-异戊醇按体积分数比为25∶24∶1,氯仿-异戊醇按体积分数比为24∶1。
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