[发明专利]基于单分子测序的融合基因检测的方法在审

专利信息
申请号: 202310014169.1 申请日: 2023-01-05
公开(公告)号: CN116064821A 公开(公告)日: 2023-05-05
发明(设计)人: 蒋传贵;凌之浩;白丽军 申请(专利权)人: 成都基预科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6869
代理公司: 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 代理人: 杨春
地址: 610041 四川省成都市高新*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明公开了基于单分子测序的融合基因检测的方法,包括步骤1:对样本进行核酸提取,步骤2:设计单分子的探针,在每个exon连接处往左右各延伸一条探针,若exon长度大于1000dp,则在该exon中间增加一条探针,步骤3:使用探针对核酸进行RNA反转录,得到转录组,步骤4:构建单分子文库,步骤5:对转录组进行靶向富集和捕获,步骤6:对进行靶向富集和捕获后的转录组进行上机测序,步骤7:收集测序数据,得到单分子的reads,进行分析,得出结论,一个单分子能够完整的跨越基因融合断点,使用单分子测序解决了转录本重组装困难的问题,使用kmer计算融合断点,减少了计算量,增加了计算精度,进行靶向捕获,可提高低频基因融合的检出率,减少检测成本和时间。
搜索关键词: 基于 分子 融合 基因 检测 方法
【主权项】:
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