[发明专利]类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法在审
| 申请号: | 202211155463.6 | 申请日: | 2022-09-21 |
| 公开(公告)号: | CN115491414A | 公开(公告)日: | 2022-12-20 |
| 发明(设计)人: | 万磊;刘健;黄传兵;王坤;李舒;朱子衡;姜辉 | 申请(专利权)人: | 安徽中医药大学第一附属医院(安徽省中医院) |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 合肥辉达知识产权代理事务所(普通合伙) 34165 | 代理人: | 汪守勇 |
| 地址: | 230031 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | 本发明涉及一种类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法。本发明采用高通量测序结合甲基化RNA免疫沉淀和RNA测序获得RA患者滑膜的全转录组m6A修饰,并进一步对下游信号通路进行富集。发现RA滑膜中有2025个转录本存在差异甲基化位点,其中1016个peaks显著上调,1009个peaks显著下调;通过m6A‑seq和RNA‑seq的联合分析显示,共有120个基因在m6A修饰和mRNA表达上都有显着变化;GO和KEGG分析表明,差异表达的m6A基因与巨噬细胞活化参与的免疫反应、血管内皮、MAPK信号通路、PI3K‑Akt信号等炎症过程密切相关。 | ||
| 搜索关键词: | 类风湿 关节炎 转录 m6a 甲基化 修饰 差异 表达 综合分析 方法 | ||
【主权项】:
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