[发明专利]类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法在审

专利信息
申请号: 202211155463.6 申请日: 2022-09-21
公开(公告)号: CN115491414A 公开(公告)日: 2022-12-20
发明(设计)人: 万磊;刘健;黄传兵;王坤;李舒;朱子衡;姜辉 申请(专利权)人: 安徽中医药大学第一附属医院(安徽省中医院)
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858
代理公司: 合肥辉达知识产权代理事务所(普通合伙) 34165 代理人: 汪守勇
地址: 230031 *** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明涉及一种类风湿关节炎全转录组m6A甲基化修饰差异表达的综合分析方法。本发明采用高通量测序结合甲基化RNA免疫沉淀和RNA测序获得RA患者滑膜的全转录组m6A修饰,并进一步对下游信号通路进行富集。发现RA滑膜中有2025个转录本存在差异甲基化位点,其中1016个peaks显著上调,1009个peaks显著下调;通过m6A‑seq和RNA‑seq的联合分析显示,共有120个基因在m6A修饰和mRNA表达上都有显着变化;GO和KEGG分析表明,差异表达的m6A基因与巨噬细胞活化参与的免疫反应、血管内皮、MAPK信号通路、PI3K‑Akt信号等炎症过程密切相关。
搜索关键词: 类风湿 关节炎 转录 m6a 甲基化 修饰 差异 表达 综合分析 方法
【主权项】:
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