[发明专利]一种通过测序方法检测基因编辑脱靶的方法在审

专利信息
申请号: 202210501155.8 申请日: 2022-05-09
公开(公告)号: CN115044661A 公开(公告)日: 2022-09-13
发明(设计)人: 许志敏;常卫东;李红梅;王春晓 申请(专利权)人: 上海达澈生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/113
代理公司: 北京深川专利代理事务所(普通合伙) 16058 代理人: 李焕焕
地址: 201600 上海市松江区*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种通过测序方法检测基因编辑脱靶的方法,包括DNA提取、sgRNA准备、DNA超声并纯化、DNA末端处理、核酸外切酶处理、T4PNK处理、DNA环化、线性DNA消化、Cas9消化、DNA处理、文库扩增十一个步骤。本发明的原理是利用Cas9体外核酸酶特性,在体外对基因组DNA进行切割,产物经处理后,通过测序或其他手段,实现对脱靶位点的筛选。Cas9体外消化基因组DNA、测序,实现了无偏检测。相比于现有GUIDE‑seq技术,不需额外引入dsODN,在各步骤共同支持下,在步骤10中实现了利用Cas9自身特性就可以切割目的片段,避免了转染效率不可控的问题;而且能够对全基因组进行检测,解决了dsODNs标签可能检测不到的遗漏情况。基于上述,本发明具有好的应用前景。
搜索关键词: 一种 通过 方法 检测 基因 编辑 脱靶
【主权项】:
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