[发明专利]一种检测牦牛RNA编辑位点的方法及装置有效
| 申请号: | 201911413840.X | 申请日: | 2019-12-31 |
| 公开(公告)号: | CN111028885B | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
| 发明(设计)人: | 王嘉博;钟金城;柴志欣;王吉坤;王会;武志娟 | 申请(专利权)人: | 西南民族大学 |
| 主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G16B25/00;G16B30/00 |
| 代理公司: | 北京君泊知识产权代理有限公司 11496 | 代理人: | 李丹 |
| 地址: | 610041 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | 本发明适用于牦牛基因功能挖掘技术领域,提供了一种检测牦牛RNA编辑位点的方法及装置,该检测方法包括以下步骤:获取待测样品的RNA,并去除待测样品的RNA中的rRNA;将剩余的RNA转录成cDNA,并对cDNA进行高通量测序,获得RNA‑seq数据;根据RNA‑seq数据对待测样品在不同组织和/或不同环境的cDNA基因型进行鉴定,获得待测样品的cDNA基因型和RNA表达量;根据待测样品的cDNA基因型以及待测样品的RNA表达量,确定待测样品的RNA编辑位点,最后通过RNA编辑位点的蛋白编码能力改变鉴定RNA编辑位点的变异能力,确定有效变异的RNA编辑位点。本发明利用表达量对候选位点进行过滤,使结果更加可信,以排除假阳性位点,提高了预测RNA编辑位点的准确性。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 检测 牦牛 rna 编辑 方法 装置 | ||
【主权项】:
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