[发明专利]基于ddPCR检测人循环肿瘤细胞KRAS基因突变的引物、探针、试剂盒及方法在审

专利信息
申请号: 201911121768.3 申请日: 2019-12-05
公开(公告)号: CN110684849A 公开(公告)日: 2020-01-14
发明(设计)人: 张惠丹;戴敬;杨丽萍;赵洪玉 申请(专利权)人: 苏州绘真医学检验有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 32405 苏州欣达共创专利代理事务所(普通合伙) 代理人: 范玉敏
地址: 215000 江苏省苏州市苏州工业*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于ddPCR检测人循环肿瘤细胞KRAS基因突变的引物探针组、试剂盒及方法。其中,引物探针组包括检测KRAS基因2号外显子上第12号、第13号密码子突变位点的引物及探针,其中,各突变位点分别为:G12D、G12V、G12A、G12C、G12S、G12R以及G13D。本发明提供的引物和探针具有灵敏度高、特异性强的优点,引物和探针能够特异性结合突变序列,且结合稳定,能够实现单拷贝模板条件下的有效扩增,且单模板扩增的ddPCR可以消除野生型模板带来的干扰。本发明提供的试剂盒具有高效、成本低、精度高、灵敏度高、准确度高、重复性好、样本投入低、可以进行绝对定量检测的优点。
搜索关键词: 探针 引物 引物探针 灵敏度 试剂盒 扩增 循环肿瘤细胞 密码子突变 特异性结合 准确度 定量检测 特异性强 突变位点 突变序列 单拷贝 单模板 野生型 检测 位点 突变 样本
【主权项】:
1.一种基于ddPCR检测人循环肿瘤细胞KRAS基因突变的引物探针组,其特征在于,包括检测KRAS基因2号外显子上第12号、第13号密码子突变位点的引物及探针,其中,各突变位点分别为:G12D、G12V、G12A、G12C、G12S、G12R以及G13D;/n其中,用于检测KRAS基因2号外显子上第12号密码子各突变位点的上游引物序列为:/nGATTCTGAATTAGCTGTATCGTC(SeqID NO:1),/n用于检测KRAS基因2号外显子上第12号密码子各突变位点的下游引物序列为:/nGGCCTGCTCAAAATGACTG(SeqID NO:2),/n用于检测KRAS基因2号外显子上第13号密码子突变位点的上游引物序列为:/nGGTCCTGCACCAGTAATATG(SeqID NO:3),/n用于检测KRAS基因2号外显子上第13号密码子突变位点的下游引物序列为:/nTAGGCAAGAGTGCCTTGAC(SeqID NO:4),/n用于检测KRAS G12D突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCACTAGCTCCAAC(SeqID NO:5)/n用于检测KRAS G12V突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCACAAGCTCCAAC(SeqID NO:6),/n用于检测KRAS G12A 突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCACGAGCTCCAAC(SeqID NO:7),/n用于检测KRAS G12C 突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCAACAGCTCCAAC(SeqID NO:8),/n用于检测KRAS G12S突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCATCAGCTCCAAC(SeqID NO:9),/n用于检测KRAS G12R突变位点的荧光探针序列为:/nCCTACGCCAGCAGCTCCAAC(SeqID NO:10),/n用于检测KRAS G13D突变位点的荧光探针序列为:/nGATCATATTCGTTCACAAAATG (SeqID NO:11)。/n
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