[发明专利]地乌/地乌基原植物DNA条形码鉴定方法在审
| 申请号： | 201910963774.7 | 申请日： | 2019-10-11 |
| 公开（公告）号： | CN110592261A | 公开（公告）日： | 2019-12-20 |
| 发明（设计）人： | 陈士林;胡志刚;汤钰文;黄必胜;胡鑫;裴红;鲁展雨 | 申请（专利权）人： | 广州康和药业有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司： | 44259 广州凯东知识产权代理有限公司 | 代理人： | 贺秀梅 |
| 地址： | 511440 广东省*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种地乌/地乌基原植物DNA条形码鉴定方法，包括如下步骤：提取待测样品的总DNA，以ITS2F/3R为引物对提取的总DNA序列进行PCR扩增，测序，再使用CondonCode Aligner软件进行拼接及5.8S和28S端保守序列的剪切，获得样品ITS2序列；把获得的待测样品的ITS2序列与地乌/地乌基原植物的ITS2序列进行K2P遗传距离和系统邻接树比较；如待测样品的种内最大K2P遗传距离小于其与混伪品最小种间K2P遗传距离，或经系统邻接树比较为同一支，则待测样品为真品。本发明方法能够利用ITS2序列鉴定地乌以及地乌基原植物；本发明方法能够把地乌、地乌基原植物与同属近缘混伪品进行区分，丰富了该物种DNA条形码的鉴定范围。 | ||
| 搜索关键词： | 地乌 待测样品 原植物 遗传距离 邻接 总DNA 伪品 保守序列 剪切 再使用 测序 小种 引物 真品 拼接 物种 | ||
【主权项】：
1.一种地乌/地乌基原植物DNA条形码鉴定方法，其特征在于：/n包括如下步骤：/n(1)提取待测样品的总DNA，将提取的总DNA序列进行PCR扩增，测序得到峰图，再使用CondonCodeAligner软件对峰图拼接并剪切其5.8S和28S端保守序列，得到ITS2序列；/n(2)把步骤(1)获得的待测样品的ITS2序列与地乌/地乌基原植物的ITS2序列进行K2P遗传距离和系统邻接树比较；/n(3)如待测样品与地乌/地乌基原植物的ITS2序列的种内最大K2P遗传距离小于其与混伪品最小种间K2P遗传距离，或经系统邻接树比较为同一支，则待测样品为真品。/n
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