[发明专利]一种石蜡切片组织RNA分析方法在审
| 申请号： | 201910962113.2 | 申请日： | 2019-10-11 |
| 公开（公告）号： | CN110684830A | 公开（公告）日： | 2020-01-14 |
| 发明（设计）人： | 黄毅;易鑫;吴玲清;刘久成;王长希;李俊 | 申请（专利权）人： | 深圳吉因加医学检验实验室 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6886;G16B30/00 |
| 代理公司： | 11594 北京知联天下知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人： | 张陆军;张迎新 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市坪山区坑*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种石蜡切片组织RNA分析方法，所述分析方法包括以下步骤：对石蜡切片组织进行DNA降解，提取样本RNA；制备石蜡切片样本核酸文库，并对样本RNA进行测序；对测序得到的样本数据进行质控；将质控后的样本数据与参考基因组进行比对，并对比对结果进行质控；再对比对结果质控后的样本数据进行转录组组装和转录本定量，对基因表达进行定量分析、基因差异表达分析以及融合基因分析。本发明提供了一种完整地评估石蜡切片组织RNA质量的指标及检测方法，能够对石蜡切片组织RNA进行综合评估，评估结果准确有效，为后续分析的准确性提供了有效的参考依据。 | ||
| 搜索关键词： | 石蜡切片 质控 样本数据 测序 样本 基因差异表达 定量分析 参考依据 后续分析 基因表达 评估结果 融合基因 样本核酸 综合评估 分析 基因组 转录本 转录组 比对 文库 制备 组装 参考 检测 评估 | ||
【主权项】：
1.一种石蜡切片组织RNA分析方法，其特征在于，所述分析方法包括以下步骤：/n对石蜡切片组织进行DNA降解，提取样本RNA；/n制备石蜡切片样本核酸文库，并基于所述文库，对所述样本RNA进行测序；/n对测序得到的所述样本数据进行质控，去除掉rRNA数据；/n将质控后的样本数据与参考基因组进行比对，并对所述比对结果进行质控；/n所述质控后的样本数据进行转录组组装和转录本定量，对基因表达进行定量分析；/n基于所述转录本定量结果，进行基因差异表达分析。/n
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