[发明专利]一种短串联重复序列通用探针及其设计方法和应用在审
| 申请号： | 201910559128.4 | 申请日： | 2019-06-26 |
| 公开（公告）号： | CN110343757A | 公开（公告）日： | 2019-10-18 |
| 发明（设计）人： | 朱海涛;李旭新;夏江 | 申请（专利权）人： | 领航基因科技（杭州）有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6883 | 分类号： | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 陆惠中;田欢 |
| 地址： | 310000 浙江省杭州市江*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明涉及体外诊断领域，具体涉及一种用于同时检测基因组多个位点的通用探针和引物设计方法及其应用试剂盒。所述通用探针采用短串联重复序列作为骨架序列，解决了拷贝数浓度放大的反应体系内探针数量过多，易于形成非特异性扩增及合成成本高昂的问题。通过在待测染色体单拷贝基因片段通用探针位置的两侧设计多对引物，实现了染色体拷贝数浓度的等比例放大，尤其适用于某些极低浓度样品的检测(例如无创检测染色体拷贝数是否发生变异)。 | ||
| 搜索关键词： | 通用探针 短串联重复序列 染色体拷贝 极低浓度样品 单拷贝基因 等比例放大 多对引物 非特异性 骨架序列 合成成本 体外诊断 无创检测 引物设计 应用试剂 基因组 拷贝数 检测 个位 染色体 扩增 探针 放大 应用 | ||
【主权项】：
1.一种用于数字PCR的探针，其特征在于，所述探针的序列采用短串联重复序列作为骨架序列，所述短串联重复序列按照重复基序区分，包括单一型(用结构式(X)n表示)、复合型(用结构式(X)n(Y)m表示)和间断型(用结构式(X)n Z(Y)m表示)，其中X为A、C、G、T四种碱基中的一种或2‑6个碱基组合，Y为A、C、G、T四种碱基中不同于X的一种或2‑6个碱基组合，Z为A、C、G、T四种碱基中不同于X和Y的一种或多个碱基的组合，n和m为重复的单元数。
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