[发明专利]一种山桐子高质量DNA提取方法在审
申请号: | 201910183544.9 | 申请日: | 2019-03-12 |
公开(公告)号: | CN109880822A | 公开(公告)日: | 2019-06-14 |
发明(设计)人: | 徐阳;龚榜初;吴开云;孙维敏;江锡兵;章平生 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 何文豪 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明属于DNA提取技术领域,公开了一种山桐子高质量DNA提取方法。本发明以CTAB法为框架,研磨时加入防氧化剂,裂解前,进行PEG洗脱,并优化后续CTAB法操作步骤,形成包括材料采集、材料研磨、PEG洗脱、CTAB裂解、萃取、DNA沉淀与收集等步骤的一种山桐子高质量DNA提取方法。本方法提取的山桐子DNA,浓度高,纯度高,DNA质量显著优于现有方法,浓度平均为438.93ng/ul,为试剂盒法的8.5倍,OD260/280比值在1.94‑1.97间,OD260/230比值在2.1‑2.17间,蛋白质污染,DNA糖类与盐污染均得到极好控制,DNA完整。实施例显示,本法提取的山桐子DNA可以满足SSR标记分型、简化基因组测序等分子试验所需;同时本方法不使用苯酚进行复萃取,在简化试验步骤,缩短试验时间的同时,也减少有机溶剂对人体健康的损害。 | ||
搜索关键词: | 高质量DNA 研磨 裂解 洗脱 萃取 糖类 简化试验步骤 蛋白质污染 基因组测序 材料采集 方法提取 防氧化剂 人体健康 试剂盒法 有机溶剂 盐污染 试验 苯酚 分型 损害 优化 | ||
【主权项】:
1.一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于,包括材料采集、材料研磨、PEG洗脱、CTAB裂解、萃取、DNA沉淀与收集,具体步骤如下:S1,材料采集:采集各样本山桐子嫩叶,然后装于冻存管立即存于液氮中,转移至‑80℃冰箱保存;S2,材料研磨:将嫩叶放入研钵中,加入液氮充分研磨,研磨样品时加入了1/10样本重量的防氧化剂,混合粉末加入2ml离心管中;S3,PEG洗脱:向装有样品粉末的2ml离心管中加入1‑1.2mlPEG洗脱液,翻转混匀,室温静止片刻,离心收集沉淀,重复洗涤多次;S4,CTAB裂解:向经PEG漂洗液的材料中加入1ml裂解液,65℃裂解后,离心取上清;S5,萃取:向S4中所得上清液,加入同体积的氯仿:异戊醇(24:1)混合液,翻转混匀,静置5min,12000rpm离心10min,将上清转入一新的2ml的离心管中;反复该步骤2‑3次;S6,DNA沉淀与收集:上清液转入2ml离心管中,加等体积的预冷异丙醇与0.1体积的3M醋酸钠(pH5.2),翻转; 置于‑20℃放置2hrs,4℃,12000rpm离心20min,弃上清液,加1ml 70%乙醇洗DNA沉淀,转入1.5ml离心管,12000rpm离心5min,倒掉上清,通风干燥约40min,保证DNA充分干燥;加100μl体积的ddH2O溶解DNA,完全溶解后,进行检测或‑20℃保存。
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