[发明专利]一种山桐子高质量DNA提取方法在审
申请号: | 201910183544.9 | 申请日: | 2019-03-12 |
公开(公告)号: | CN109880822A | 公开(公告)日: | 2019-06-14 |
发明(设计)人: | 徐阳;龚榜初;吴开云;孙维敏;江锡兵;章平生 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 何文豪 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 高质量DNA 研磨 裂解 洗脱 萃取 糖类 简化试验步骤 蛋白质污染 基因组测序 材料采集 方法提取 防氧化剂 人体健康 试剂盒法 有机溶剂 盐污染 试验 苯酚 分型 损害 优化 | ||
1.一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于,包括材料采集、材料研磨、PEG洗脱、CTAB裂解、萃取、DNA沉淀与收集,具体步骤如下:
S1,材料采集:采集各样本山桐子嫩叶,然后装于冻存管立即存于液氮中,转移至-80℃冰箱保存;
S2,材料研磨:将嫩叶放入研钵中,加入液氮充分研磨,研磨样品时加入了1/10样本重量的防氧化剂,混合粉末加入2ml离心管中;
S3,PEG洗脱:向装有样品粉末的2ml离心管中加入1-1.2mlPEG洗脱液,翻转混匀,室温静止片刻,离心收集沉淀,重复洗涤多次;
S4,CTAB裂解:向经PEG漂洗液的材料中加入1ml裂解液,65℃裂解后,离心取上清;
S5,萃取:向S4中所得上清液,加入同体积的氯仿:异戊醇(24:1)混合液,翻转混匀,静置5min,12000rpm离心10min,将上清转入一新的2ml的离心管中;反复该步骤2-3次;
S6,DNA沉淀与收集:上清液转入2ml离心管中,加等体积的预冷异丙醇与0.1体积的3M醋酸钠(pH5.2),翻转; 置于-20℃放置2hrs,4℃,12000rpm离心20min,弃上清液,加1ml70%乙醇洗DNA沉淀,转入1.5ml离心管,12000rpm离心5min,倒掉上清,通风干燥约40min,保证DNA充分干燥;加100μl体积的ddH2O溶解DNA,完全溶解后,进行检测或-20℃保存。
2.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S1中春季采集各样本山桐子嫩叶在春季,以早春为宜,约3月底-4月中旬。
3.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S2中防氧化剂聚乙烯吡咯烷酮PVP。
4.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S2中混合粉末加入2ml离心管中,加至2/5处为佳。
5.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S3中,PEG洗脱液的配置:4.5mmol/LEDTA,pH=8.0;45mmol/LTris-HCl ,pH=8.0,300mmol/L山梨醇,8.5%PEG8000,用前加入0.5%β-巯基乙醇。
6.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S3中,室温静止片刻,静止时间以1min为宜,离心收集沉淀,离心转速为2000rpm,离心时间为45s。
7.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S3中,重复洗涤多次,重复次数以3次为佳。
8.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S4中,65℃裂解时间为30min,裂解后,离心取上清,离心转速为6000rpm,离心时间为5min。
9.根据权利要求1所述的一种山桐子高质量DNA提取方法,其特征在于:S5中,萃取结束标准为:分离相中间层无杂质或杂质较少,上清液清澈。
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