[发明专利]肿瘤新生抗原负荷检测装置及存储介质在审
| 申请号： | 201811642537.2 | 申请日： | 2018-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN109706065A | 公开（公告）日： | 2019-05-03 |
| 发明（设计）人： | 李淼;王佳茜;高志博;陈龙昀;陈超 | 申请（专利权）人： | 深圳裕策生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12M1/34 | 分类号： | C12M1/34;C12M1/00;G16B30/00 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 孙银行;彭家恩 |
| 地址： | 518081 广东省深圳市盐田区*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 一种肿瘤新生抗原负荷检测装置及存储介质，该检测装置包括：数据获取单元，用于获取检测对象的肿瘤组织DNA、对照样本DNA和肿瘤组织RNA的靶向捕获区域的测序数据；体细胞变异检测单元，用于对肿瘤组织DNA和对照样本DNA的测序数据进行变异检测和注释得到突变肽段；融合基因检测单元，用于对肿瘤组织RNA的测序数据进行融合基因检测和注释得到突变肽段；HLA分型检测单元，用于对对照样本DNA的靶向捕获区域的测序数据进行HLA分型；MHC亲和力预测单元，用于对突变肽段使用HLA分型检测结果预测新生抗原；TNB计算单元，用于计算TNB；和结果输出单元，用于输出TNB检测结果。本发明能够用于肿瘤新生抗原负荷检测监测，预测免疫检查点抑制剂疗效。 | ||
| 搜索关键词： | 测序数据 肿瘤组织 抗原 样本DNA 突变肽 负荷检测装置 检测 捕获区域 存储介质 检测结果 融合基因 肿瘤 靶向 结果输出单元 数据获取单元 亲和力预测 体细胞变异 变异检测 负荷检测 计算单元 检测对象 检测装置 免疫检查 抑制剂 预测 输出 监测 | ||
【主权项】：
1.一种肿瘤新生抗原负荷检测装置，其特征在于，所述检测装置包括：数据获取单元，用于获取检测对象的肿瘤组织DNA、对照样本DNA和肿瘤组织RNA的靶向捕获区域的测序数据；体细胞变异检测单元，用于对所述肿瘤组织DNA和对照样本DNA的靶向捕获区域的测序数据进行变异检测以发现体细胞突变，并对所述体细胞突变进行注释及计算突变位点前后第一设定数量的氨基酸的变化情况，作为突变肽段；融合基因检测单元，用于对所述肿瘤组织RNA的靶向捕获区域的测序数据进行融合基因检测以发现融合基因，并对所述融合基因进行注释及计算融合位点前后第二设定数量的氨基酸的变化情况，作为突变肽段；HLA分型检测单元，用于对所述对照样本DNA的靶向捕获区域的测序数据进行HLA分型以获得HLA分型检测结果；MHC亲和力预测单元，用于对所述突变肽段使用所述HLA分型检测结果预测新生抗原以发现潜在新生抗原；TNB计算单元，用于按照以下公式计算TNB：TNB＝N/R，其中N为新生抗原数量，R为靶向捕获区域的实际测序区域大小；和结果输出单元，用于输出所述TNB检测结果。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳裕策生物科技有限公司，未经深圳裕策生物科技有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201811642537.2/，转载请声明来源钻瓜专利网。
