[发明专利]一种传染性肌肉坏死病毒的检测方法在审

专利信息
申请号: 201811636671.1 申请日: 2018-12-29
公开(公告)号: CN109468415A 公开(公告)日: 2019-03-15
发明(设计)人: 杨苗;林华;李建臻;陈世界;方智;张婧;安微;张妙;薛昌华 申请(专利权)人: 四川出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93
代理公司: 成都弘毅天承知识产权代理有限公司 51230 代理人: 白小明
地址: 610041 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明公开了一种传染性肌肉坏死病毒的检测方法,包括以下步骤:(1)设计特异性引物与探针;(2)优化荧光定量PCR反应体系和反应条件;(3)提取含有目的序列的质粒标准品,作为荧光定量PCR阳性模板,进行荧光定量PCR扩增,获得扩增曲线和标准曲线;(4)提取待测样品的病毒RNA,进行荧光定量PCR扩增,检测所提取病毒是否为传染性肌肉坏死病毒阳性。本发明以全基因组的5’‑3’的第835个碱基至第901个碱基为目的序列,设计特异性引物和探针,检测灵敏度高、特异性强,且检测结果的重复性高,准确可靠,对操作人员技术要求低,易于实现标准化,尤其适用于出入境对虾的检疫。
搜索关键词: 传染性肌肉坏死病毒 荧光定量PCR 特异性引物 碱基 扩增 探针 检测 荧光定量PCR反应 检测灵敏度 质粒标准品 标准曲线 待测样品 反应条件 检测结果 扩增曲线 全基因组 人员技术 特异性强 阳性模板 病毒RNA 对虾 标准化 病毒 检疫 优化
【主权项】:
1.一种传染性肌肉坏死病毒的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)引物设计:查找GenBank中的传染性肌肉坏死病毒的全基因序列,以全基因组的5’‑3’的第835个碱基至第901个碱基为目的序列,使用Primr premier软件设计特异性引物与TaqMan探针,序列如下,方向5’→3’:正向引物:GAAGCCTAAATACACATCGAC;反向引物:CTGCTTCGCTAAAACCTG;探针:AAAACCGGAGCTGACCAC,5’端用Fam标记,3’端用BHQ‑1标记;(2)优化荧光定量PCR反应体系和反应条件;(3)提取含有目的序列的质粒标准品,作为荧光定量PCR阳性模板,进行质粒浓度检测,计算出重组质粒的拷贝数,以10倍稀释度将质粒进行倍比稀释,将其作为标准质粒模板,并设立无模板对照,进行荧光定量PCR扩增,获得扩增曲线和标准曲线;(4)提取待测样品的病毒RNA,进行荧光定量PCR扩增,检测所提取病毒是否为传染性肌肉坏死病毒阳性。
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