[发明专利]胶质母细胞瘤危险分层模型及其在临床预后评估的应用

摘要

本发明提供一种建立癌症患者预后分层模型的方法。同时，本发明还提供一种胶质母细胞瘤患者预后风险评估系统。本发明还提供一种探针组，所述的探针组能够用于检测患者基因位点甲基化率，以预测胶质母细胞瘤患者预后风险，为病人预后及健康管理提供指导依据。

主权项

1.一种用于提供信息以建立胶质母细胞瘤预后风险分层模型的方法，所述的方法包括如下步骤：(1)、在TCGA数据库中选择胶质母细胞瘤的患者基因的甲基化位点的信息，利用单因素COX模型获得探针风险系数和相应p值，筛选出胶质母细胞瘤显著相关的甲基化探针组A，获取胶质母细胞瘤患者的基因甲基化位点的甲基化率，并且获得患者的生存时间信息；(2)、从癌症相关体细胞突变位点数据库获得肿瘤相关基因和从OMIM获得胶质母细胞瘤相关基因，通过对比获得交集基因，获得上述交集基因对应的探针组B；(3)、取探针组A与B的交集，去除交集中探针风险系数的异常值，获得胶质母细胞瘤相关的甲基化探针组C，利用探针组C中的各探针的由单因素COX模型得到的风险系数构建加权方程，形成风险分层模型；(4)、将步骤(1)中TCGA数据库中选择胶质母细胞瘤的患者样本的甲基化率带入风险模型给出模型值，排序后，取中位数即判断阈值，小于中位数的样本归为预后高风险组，大于等于中位数的样本归为预后低风险组。