[发明专利]一种引物组的设计方法及其应用有效
申请号: | 201811313752.8 | 申请日: | 2018-11-06 |
公开(公告)号: | CN109411011B | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 吴婷婷;李彦敏;陈淑美;蔡晓辉;杨平 | 申请(专利权)人: | 苏州泓迅生物科技股份有限公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B25/10;G06K9/62 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 215123 江苏省苏州市苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明提供了一种引物组的设计方法及其应用,通过根据扩增长度的需要,巧妙地在抗体FR1起始位点的上游,提取FR1起始位点前的序列,并从5’端的第一个碱基开始,依次移位切取固定长度的引物序列,形成候选引物库,聚类分析后筛选得到免疫组库的引物组,采用该方法得到的引物组能够显著提高多重PCR法免疫组库扩增的覆盖度和实验效率,降低扩增错配率,方法简便,节省成本。 | ||
搜索关键词: | 一种 引物 设计 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种引物组的设计方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)获取物种的抗体重链和/或轻链的种系基因数据和物种的基因组数据;(2)引物选择区域定位:将抗体重链和/或轻链的种系基因比对到物种的基因组数据上,找到抗体FR1的起始位点,提取起始位点前的序列;(3)候选引物库设计:对步骤(2)提取的起始位点前的序列进行切片,从5’端的第一个碱基开始,依次移位切取固定长度的引物序列,形成候选引物库;(4)进行cluster聚类分析,筛选得到初始引物组;(5)将初始引物组与抗体数据库比对,筛选得到最终引物组。
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