[发明专利]一种引物组的设计方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201811313752.8 申请日: 2018-11-06
公开(公告)号: CN109411011B 公开(公告)日: 2022-05-17
发明(设计)人: 吴婷婷;李彦敏;陈淑美;蔡晓辉;杨平 申请(专利权)人: 苏州泓迅生物科技股份有限公司
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B25/10;G06K9/62
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 巩克栋
地址: 215123 江苏省苏州市苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供了一种引物组的设计方法及其应用,通过根据扩增长度的需要,巧妙地在抗体FR1起始位点的上游,提取FR1起始位点前的序列,并从5’端的第一个碱基开始,依次移位切取固定长度的引物序列,形成候选引物库,聚类分析后筛选得到免疫组库的引物组,采用该方法得到的引物组能够显著提高多重PCR法免疫组库扩增的覆盖度和实验效率,降低扩增错配率,方法简便,节省成本。
搜索关键词: 一种 引物 设计 方法 及其 应用
【主权项】:
1.一种引物组的设计方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)获取物种的抗体重链和/或轻链的种系基因数据和物种的基因组数据;(2)引物选择区域定位:将抗体重链和/或轻链的种系基因比对到物种的基因组数据上,找到抗体FR1的起始位点,提取起始位点前的序列;(3)候选引物库设计:对步骤(2)提取的起始位点前的序列进行切片,从5’端的第一个碱基开始,依次移位切取固定长度的引物序列,形成候选引物库;(4)进行cluster聚类分析,筛选得到初始引物组;(5)将初始引物组与抗体数据库比对,筛选得到最终引物组。
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