[发明专利]一种疾病相关的菌群定量扩增方法在审
| 申请号： | 201810861540.7 | 申请日： | 2018-08-01 |
| 公开（公告）号： | CN108949920A | 公开（公告）日： | 2018-12-07 |
| 发明（设计）人： | 岳朋 | 申请（专利权）人： | 深圳市领治医学科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6851 | 分类号： | C12Q1/6851;C12Q1/06 |
| 代理公司： | 深圳市百瑞专利商标事务所(普通合伙) 44240 | 代理人： | 金辉 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市南山区*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种疾病相关的菌群定量扩增方法，包括三个部分，即扩增菌种的选定、菌种的引物设计和PCR(Polymerase Chain Reaction)反应程序的设计。首先，根据疾病与菌种的潜在关系，确定需要检测的菌种类型；其次，根据所确定的菌种，通过文献或者各种专业数据库查找相关菌种16SrDNA所对应的基因序列，再锁定序列中菌种特异的可变区片段，并根据该片段设计特异性的PCR引物，并检查引物特异性；最后，将提取的菌种DNA放入PCR反应管并加入四种dNTP、Mg2+、Taq聚合酶、水等反应物，并在合适的温度条件下进行扩增反应，待反应结束后根据荧光扩增吸收曲线计算各菌种的含量。本方法具有操作简单、检测快速、费用低廉、定量准确的优点，适合相关疾病的广泛筛查与预防工作，具有较好的推广性。 | ||
| 搜索关键词： | 菌种 扩增 疾病 菌群 可变区片段 引物特异性 专业数据库 反应程序 基因序列 扩增反应 潜在关系 温度条件 吸收曲线 引物设计 反应物 推广性 检测 荧光 放入 筛查 锁定 查找 预防 检查 | ||
【主权项】：
1.一种疾病相关的菌群定量扩增方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤1，根据疾病与菌种的潜在关系，确定需要检测的菌种类型；步骤2，根据所确定的菌种，通过文献或者各种专业数据库查找相关菌种16S rDNA所对应的基因序列；步骤3、锁定基因序列中菌种特异的可变区片段，并根据该可变区片段设计特异性的PCR引物，并检查PCR引物特异性；步骤4，将提取的菌种DNA放入PCR反应管并加入反应物，并在合适的温度下进行荧光扩增反应，待反应结束后根据荧光扩增扩增反应的吸收曲线计算各菌种的含量。
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