[发明专利]痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途有效

专利信息
申请号: 201810672906.6 申请日: 2018-06-26
公开(公告)号: CN108753954B 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 沈璐;焦彬;李鹏飞;范嘉庚;廖鑫鑫;王伟;李佳龙 申请(专利权)人: 中南大学湘雅医院;杭州祥音生物医药科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11;C40B50/06
代理公司: 北京睿智保诚专利代理事务所(普通合伙) 11732 代理人: 周新楣
地址: 410000*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明提供了一种痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途,涉及基因检测的技术领域,该捕获探针组包含了95个基因的编码区域,能针对特定的编码区域进行捕获,并进行高深度测序,使测序目标基因精准,测序成本降低。使用上述捕获探针组进行文库构建能对目标基因进行有效富集,降低样本量的要求,同时也能更好地控制测序成本。
搜索关键词: 痴呆 相关 基因 捕获 探针 试剂盒 文库 构建 方法 用途
【主权项】:
1.一种痴呆相关基因的捕获探针组,其特征在于,所述捕获探针组捕获的基因和所述基因的染色体坐标信息如下表所示:所述捕获探针组的设计按照如下规则:(a)探针长度为90‑150bp;(b)探针设计合并相邻区域;(c)探针设计区间为目标区间向两翼扩展20bp;(d)探针参考为基因组正义链;(e)探针两翼的共有序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;(f)探针设计中通过比对全基因组信息确保探针特异性;(g)探针GC含量以40%‑60%为标准,GC含量变化幅度偏离标准含量每增加10%,探针在该区域探针数量增加50%。(h)在基因组非捕获区域有近似序列的探针,每有一个近似序列,则该区域探针数量增加100%;所述近似序列为与探针序列的同源性至少为95%的序列。
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