[发明专利]痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途

权利要求书

1.一种痴呆相关基因的捕获探针组，其特征在于，所述捕获探针组捕获的基因和所述基因的染色体坐标信息如下表所示：

所述捕获探针组的设计按照如下规则：

(a)探针长度为90-150bp；

(b)探针设计合并相邻区域；

(c)探针设计区间为目标区间向两翼扩展20bp；

(d)探针参考为基因组正义链；

(e)探针两翼的共有序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；

(f)探针设计中通过比对全基因组信息确保探针特异性；

(g)探针GC含量以40％-60％为标准，GC含量变化幅度偏离标准含量每增加10％，探针在该区域探针数量增加50％。

(h)在基因组非捕获区域有近似序列的探针，每有一个近似序列，则该区域探针数量增加100％；所述近似序列为与探针序列的同源性至少为95％的序列。

2.根据权利要求1所述的捕获探针组，其特征在于，所述捕获探针组中的探针经过标记物标记，优选为经过生物素标记。

3.一种用于文库构建的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求1或2所述的捕获探针组；

优选地，所述试剂盒还包括用于富集捕获的靶序列的PCR扩增引物：所述PCR扩增引物具有如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示序列。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于多样本杂交捕获的接头，所述接头包括Adapters1、Adapters2、Adapters3和Adapters4中至少两组；

接头Adapters1由Adapters1-1及Adapters1-2经退火形成；所述Adapters1-1具有如SEQ ID NO.5所示序列，所述Adapters1-2具有如SEQ ID NO.6所示序列；

接头Adapters2由Adapters2-1及Adapters2-2经退火形成，所述Adapters2-1具有如SEQ ID NO.7所示序列，所述Adapters2-2具有如SEQ ID NO.8所示序列；

接头Adapters3由Adapters3-1及Adapters3-2经退火形成，所述Adapters3-1具有如SEQ ID NO.9所示序列，所述Adapters3-2具有如SEQ ID NO.10所示序列；

接头Adapters4由Adapters4-1及Adapters4-2经退火形成，所述Adapters4-1具有如SEQ ID NO.11所示序列，所述Adapters4-2具有如SEQ ID NO.12所示序列。

5.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于文库杂交前封闭的Hyb Block，所述Hyb Block包括如SEQ ID NO.13所示序列；

优选地，SEQ ID NO.13经硫代磷酸键修饰。

6.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括与探针上的标记物亲和的磁珠；

优选地，所述试剂盒中的捕获探针组中的探针经生物素标记，所述磁珠为亲和素偶联的磁珠，所述磁珠优选为链霉亲和素偶联的磁珠；

优选地，所述试剂盒还包含用于提供杂交捕获反应的离子环境的缓冲液；

优选地，所述试剂盒还包含用于洗脱物理吸附或非特异性杂交的清洗液。

7.一种文库构建方法，其特征在于，所述文库构建方法包括使用权利要求1或2所述的捕获探针组或权利要求3-6中任一项所述的试剂盒捕获痴呆相关基因。