[发明专利]肿瘤细胞DNA损伤修复相关基因捕获测序的探针制备方法

摘要

本发明公开了一种肿瘤细胞DNA损伤修复相关基因捕获测序的探针制备方法，该方法中目标基因包括58个肿瘤细胞DNA损伤修复相关基因；该方法至少包括如下步骤：步骤1：制备58个HRD基因全外显子区域探针；步骤2：捕获58个目标基因DNA；步骤3：进行洗脱程序；步骤4：PCR反应体系进行捕获目标DNA后扩增；步骤5：扩增产物用磁珠纯化后，用qubit定量至20ng/ul，分装保存。本发明的探针制备方法针对58个基因捕获，结合高通量测序平台可以十分有效的解决目前对于临床上乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌及前列腺癌等同源重组修复缺陷多基因的捕获检测。

主权项

肿瘤细胞DNA损伤修复相关基因捕获测序的探针制备方法，其特征在于：该方法中目标基因的捕获探针，为生物素标记的目标基因的特异性探针组，所述目标基因包括如下58个肿瘤细胞DNA损伤修复相关基因：RAD50、RAD51、RAD51D、RAD51C、RAD51B、Rad52、BRIP1、BARD1、BAP1、WRN、FANCA、FANCD2、FAM175A、CHEK2、CHEK1、ATM、ATR、BRCA1、BRCA2、NBN、PALB2、MRE11A、XRCC3、CDK12、c11orf30、CCNE1、FANCC、FANCI、POLQ、MMS22L、RMI2、TP53、PTEN、STK11、PI3K、TSC1、TSC2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2、EPCAM、POLE、JAK1、JAK2、NF1、NOTCH1、KRAS、MDM2、MDM4、DNMT3A、B2M、TS、ERCC2、ERCC6、MSH4、FANCM、CEP164；该方法至少包括如下步骤：步骤1：制备58个HRD基因全外显子区域探针；步骤2：捕获58个目标基因DNA；步骤3：进行洗脱程序；步骤4：PCR反应体系进行捕获目标DNA后扩增；步骤5：扩增产物用磁珠纯化后，用qubit定量至20ng/ul，分装保存。