[发明专利]基于DNA条形码的长毛明对虾和凡纳滨对虾的鉴定方法在审
申请号: | 201810009030.7 | 申请日: | 2018-01-04 |
公开(公告)号: | CN108220455A | 公开(公告)日: | 2018-06-29 |
发明(设计)人: | 王攀攀;金烨楠;易啸;王军;苏永全;毛勇 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) 35200 | 代理人: | 马应森 |
地址: | 361005 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 基于DNA条形码的长毛明对虾和凡纳滨对虾的鉴定方法,根据长毛明对虾和凡纳滨对虾线粒体基因组全序列,设计扩增细胞色素C氧化酶I(COI)基因片段的引物COIF和COIR;提取长毛明对虾和凡纳滨对虾的基因组DNA,利用引物COIF和COIR进行PCR反应;将PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测,测序验证;利用MEGA7.0比对获得的序列,利用DNAMAN预测各种对虾代表序列的酶切位点;取待放流的长毛明对虾F1代仔虾和亲虾,提取基因组DNA;利用COIF和COIR,对DNA模板F1~F4,P1~P4,V1,V2,Y1,Y2,V1+Y1,V2+Y2进行PCR扩增,将PCR扩增产物酶切,酶切产物进行电泳鉴定。 | ||
搜索关键词: | 对虾 凡纳滨对虾 引物 琼脂糖凝胶电泳检测 提取基因组DNA 线粒体基因组 基因组DNA 细胞色素C 电泳鉴定 基因片段 酶切产物 酶切位点 全序列 氧化酶 比对 测序 扩增 酶切 仔虾 验证 预测 | ||
【主权项】:
1.基于DNA条形码的长毛明对虾和凡纳滨对虾的鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:1)根据长毛明对虾(NC_026885.1)和凡纳滨对虾(NC_009626.1)线粒体基因组全序列,设计扩增细胞色素C氧化酶I(COI)基因片段的引物COIF和COIR;2)提取长毛明对虾和凡纳滨对虾的基因组DNA,利用引物COIF和COIR进行PCR反应;3)将步骤2)中获得的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,并测序验证;4)利用MEGA7.0比对获得的序列,同时利用DNAMAN(Version9.0)预测各种对虾代表序列的酶切位点;5)取待放流的长毛明对虾F1代仔虾和亲虾,分别提取基因组DNA;6)利用COIF和COIR,对DNA模板F1~F4,P1~P4,V1,V2,Y1,Y2,V1+Y1(1︰1),V2+Y2(1︰1)进行PCR扩增,再将所述的PCR扩增产物进行酶切,酶切产物进行电泳鉴定。
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