[发明专利]使用SWATH方法扩展动态范围

摘要

本发明公开用于确定质谱分析法中的定量的动态范围是否可扩展的系统和方法。在多个采集时间中的每个采集时间，对于所关注化合物的样品执行DIA方法。对于两个或更多个前体离子质量选择窗口中的每个窗口，产生多个产物离子谱。选择所述所关注化合物的已知产物离子。从所述已知产物离子的两个或更多个不同前体离子窗口计算两个或更多个XIC。计算所述两个或更多个XIC中的一个XIC对于所述两个或更多个XIC中的至少一个其它XIC的比率。如果所述比率高于阈值，那么在所述定量中使用所述XIC。如果不高于阈值，那么两个或更多个XIC可被组合为用于所述定量的单个XIC。

主权项

1.一种用于通过使用数据独立采集DIA方法组合针对相同产物离子从已知所关注化合物的两个或更多个不同前体离子产生的两个或更多个产物离子提取离子层析图XIC来扩展所述已知所关注化合物的定量计算的动态范围的系统，其包括：(a)样品引入装置，其随时间推移引入包含一或多种所关注化合物的样品；(b)离子源装置，其电离所述样品来将所述样品转换为离子束；(c)串列式质谱仪，其将所关注前体离子质量范围划分为用于DIA方法的多个前体离子质量选择窗口，并且通过以下方式对所述离子束执行所述DIA方法：在多个采集时间中的每个采集时间，对于所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体质量选择窗口，在所述窗口中分裂前体离子从而产生产物离子并且质量分析所产生的所述产物离子，跨越所述多个采集时间产生所述多个前体离子质量选择的每个窗口的多个产物离子谱；以及(d)与所述串列式质谱仪通信的处理器，其(d)(i)从所述串列式质谱仪接收所述多个前体离子质量选择窗口中的每个窗口的多个产物离子谱，(d)(ii)对于所述一或多种所关注化合物中的所关注化合物的至少一个已知产物离子，选择质荷比m/z值；(d)(iii)从所述多个前体离子质量选择窗口中的两个或更多个不同窗口中的每一个的多个产物离子谱计算所述m/z值的XIC，从而产生两个或更多个XIC，(d)(iv)将所述两个或更多个XIC组合为具有更大动态范围的单个XIC，以及(d)(v)使用所述单个XIC计算所述所关注化合物的量。