[发明专利]使用SWATH方法扩展动态范围

权利要求书

1.一种用于通过组合使用数据独立采集DIA方法针对相同产物离子从已知所关注化合物的两种或更多种不同前体离子产生的两个或更多个产物离子提取离子层析图XIC来扩展已知所关注化合物的定量计算的动态范围的系统，所述系统包括：

(a)样品引入装置，所述样品引入装置随时间引入包含一种或多种所关注化合物的样品；

(b)离子源装置，所述离子源装置电离所述样品来将所述样品转换为离子束；

(c)串列式质谱仪，所述串列式质谱仪将所关注前体离子质量范围划分为多个前体离子质量选择窗口以用于DIA方法，并且通过以下方式对所述离子束执行所述DIA方法：在多个采集时间中的每个采集时间处，对于所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口，分裂前体离子质量选择窗口中的前体离子从而产生产物离子并且对所产生的产物离子进行质量分析，跨越所述多个采集时间产生所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的多个产物离子谱；以及

(d)与所述串列式质谱仪通信的处理器，所述处理器

(d)(i)从所述串列式质谱仪接收所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的多个产物离子谱，

(d)(ii)选择所述一种或多种所关注化合物中的所关注化合物的至少一种已知产物离子的单个质荷比m/z值；

(d)(iii)根据所述多个前体离子质量选择窗口中的两个或更多个不同前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的多个产物离子谱计算针对所述单个m/z值的XIC，从而产生针对所述单个m/z值的两个或更多个XIC，

(d)(iv)将所述两个或更多个XIC组合为具有更大动态范围的单个XIC，以及

(d)(v)使用所述单个XIC计算所关注化合物的量。

2.根据权利要求1所述的系统，其中步骤(d)(iv)包括将所述两个或更多个XIC相加成具有更大动态范围的所述单个XIC。

3.根据权利要求1所述的系统，其中步骤(d)(iii)和(d)(iv)包括

根据所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的所述多个产物离子谱计算针对所述单个m/z值的XIC，从而产生所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的XIC，以及

将所述多个前体离子质量选择窗口中的全部前体离子质量选择窗口的XIC组合成具有更大动态范围的单个XIC。

4.根据权利要求1所述的系统，其中步骤(d)(iii)和(d)(iv)包括

根据所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的所述多个产物离子谱计算针对所述单个m/z值的XIC，从而产生所述多个前体离子质量选择窗口中的每个前体离子质量选择窗口的XIC，

组合所述多个前体离子质量选择窗口中的全部前体离子质量选择窗口的XIC的组合，从而产生多个XIC组合，

为所关注化合物选择所述多个XIC组合中的具有最大动态范围的组合XIC。

5.根据权利要求1所述的系统，其中步骤(d)(iv)进一步包括组合所述多个前体离子质量选择窗口中的所述两个或更多个不同前体离子质量选择窗口的所述两个或更多个XIC，而不用确定所述两个或更多个不同前体离子质量选择窗口是否包含所关注化合物的已知前体离子。

6.根据权利要求1所述的系统，其中步骤(d)(iv)包括通过计算所述两个或更多个XIC的加权和来将所述两个或更多个XIC组合成单个XIC。

7.根据权利要求6所述的系统，其中所述处理器根据滞留时间、与主导前体离子的相关度、质量精度、与干扰前体离子的相关度或信噪比来对所述两个或更多个XIC进行加权。

8.根据权利要求6所述的系统，其中所述处理器根据在分裂所述两个或更多个XIC中的每个XIC的前体离子时所述串列式质谱仪的相对响应来对所述两个或更多个XIC进行加权。