[发明专利]使用SWATH方法扩展动态范围

说明书

本发明公开用于确定质谱分析法中的定量的动态范围是否可扩展的系统和方法。在多个采集时间中的每个采集时间，对于所关注化合物的样品执行DIA方法。对于两个或更多个前体离子质量选择窗口中的每个窗口，产生多个产物离子谱。选择所述所关注化合物的已知产物离子。从所述已知产物离子的两个或更多个不同前体离子窗口计算两个或更多个XIC。计算所述两个或更多个XIC中的一个XIC对于所述两个或更多个XIC中的至少一个其它XIC的比率。如果所述比率高于阈值，那么在所述定量中使用所述XIC。如果不高于阈值，那么两个或更多个XIC可被组合为用于所述定量的单个XIC。

相关申请的交叉引用

本申请案主张2016年6月15日申请的美国临时专利申请案第62/350,325号的权益，所述申请案以全文引用的方式并入本文中。

技术领域

本文中的教示涉及扩展液相层析质谱法(liquid chromatography massspectrometry；LC-MS)或液相层析质谱法/质谱分析法(liquid chromatography massspectrometry/mass spectrometry；LC-MS/MS)中的所关注化合物的可定量范围。更确切地说，本文中的教示涉及用于通过在LC-MS/MS中使用数据独立采集(data independentacquisition；DIA)方法，并且组合来自两个或更多个前体离子的已知特定产物离子的密集度，来扩展所关注化合物的可定量范围的系统和方法。

背景技术

LC-MS和LC-MS/MS背景

质谱分析法(mass spectrometry；MS)是基于从那些化合物形成的离子的质荷比(mass-to-charge ratio；m/z)而检测和定量化合物的分析技术。质谱分析法(MS)和液相层析(liquid chromatography；LC)的组合是用于鉴定和定量混合物内的化合物的重要分析工具。一般来说，在液相层析中，被分析的流体样品穿过填充有经化学处理的固体吸附材料(通常以较小固体颗粒形式，例如，二氧化硅)的塔。由于混合物组分与固体吸附材料(通常被称作固定相)的略微不同的相互作用，不同组分可具有不同的贯穿填充塔运输(溶离)时间，导致各种组分的分离。在LC-MS中，离开LC塔的流出物可以持续地经历质谱分析。来自这一分析的数据可被处理以产生提取离子层析图(extracted ion chromatogram；XIC)，其可能描绘所检测离子密集度(一或多个特定被分析物的所检测离子数目的量度)作为滞留时间的函数。

在某些情况下，LC流出物可经历串列式质谱(或质谱/质谱MS/MS)以用于鉴定对应于XIC中的峰的产物离子。举例来说，可基于它们的质/荷比而选择前体离子，以进行后续质量分析阶段。举例来说，所选前体离子可被分裂(例如，借助碰撞诱导解离)，且可借助后续质谱阶段分析被分裂离子(产物离子)。

串列式质谱或MS/MS背景

串列式质谱或MS/MS涉及从样品电离一或多种所关注化合物、选择一或多个化合物的一或多个前体离子、将一或多个前体离子分裂成产物离子，以及对产物离子质量分析。

串列式质谱可能提供定性和定量信息。产物离子质谱可用于识别所关注分子。一或多个产物离子的密集度可用于定量存在于样品中的化合物的量。

可使用串列式质谱仪执行大量不同类型的实验方法或工作流程。这些工作流程可包含但不限于针对性采集、信息依赖型采集(information dependent acquisition；IDA)或数据依赖型采集(data dependent acquisition；DDA)，以及数据独立采集(dataindependent acquisition；DIA)。