[发明专利]一组多梳蛋白靶基因及其筛选方法和应用在审

专利信息
申请号: 201711127622.0 申请日: 2017-11-15
公开(公告)号: CN107868788A 公开(公告)日: 2018-04-03
发明(设计)人: 谢浩;方明;廖艳林;王明滢;陈萌萌 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12N15/12 分类号: C12N15/12;C12Q1/6886;G06F19/20
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司32200 代理人: 黄欣
地址: 210096 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一组多梳蛋白靶基因及其筛选方法和应用。首先在ModENCODE数据库中检索果蝇胚胎PcG结合相关的ChIP‑seq数据,找到有PcG结合的靶基因。结合PcGRNAi之后的RNA‑seq的数据以及统计分析,筛选得到PcG特异结合的相关的基因。本发明通过搜集已有的ChIP‑seq数据,结合PcG与靶基因之间的调控关系以及芯片等数据,筛选得到的基因可以作为PcG直接结合并发挥调控功能的基因,这些基因在细胞的增殖分化中起重要作用,同时可以用来筛选潜在的原癌基因。
搜索关键词: 一组 蛋白 基因 及其 筛选 方法 应用
【主权项】:
一组多梳蛋白靶基因,其特征在于:包括ococ、nub、iab‑4、btd、opa、grn、retn、Dll、unpg、mab‑21、Kr、disco‑r、so、E5、ap、drm、dac、ems、slp2、Vsx1、Ptx1、Oaz、Lim1、Vsx2、dve、rpr、pdm2、lab、pros、wg、peb、Sox100B、tsh、kn、CG14762、Drl‑2、CG31778、CG8157、Psc、Sox102F、CG13321、ss、Su(z)2、KP78a、GATAe、klu、KP78b、gsb‑n、D、slgA、elB、lz、zfh2、Apt、bab2、CG32121、SoxN、CG10357、Hexo2、mirr、Ama、Zasp52、modSP、fkh、tio、CG33465、CG5613、CG9328、Sr‑CIV、Antp、abd‑A、Abd‑B、bi、svp、disco、Ubx、cad、salm、vvl、pnr、vg、hth、unc‑4、trh、H15、Dfd、Rh5、eya。
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