[发明专利]利用转录组测序的SSR分子标记鉴定火龙果种质的方法有效

专利信息
申请号: 201710620537.1 申请日: 2017-07-26
公开(公告)号: CN107190097B 公开(公告)日: 2021-04-30
发明(设计)人: 文晓鹏;杨仕美;乔光 申请(专利权)人: 贵州大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858
代理公司: 贵阳中新专利商标事务所 52100 代理人: 李余江;程新敏
地址: 550025 贵州省贵*** 国省代码: 贵州;52
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摘要: 发明公开了一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定火龙果种质的方法,该方法设计序列表所示的EST‑SSR标记引物并包括以下步骤:S1,取火龙果幼嫩茎尖,用于提取基因组DNA;S2,基于火龙果转录组测序的序列设计SSR引物,并进行PCR扩增体系优化;S3,PCR采用10μl反应体系:包含10‑50ng模板DNA 1‑2μl,正、反向引物各0.2‑0.5μl,5μl Mix及适量ddH2O;S4,PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃反应30s,54‑63℃反应30s,72℃反应30s,进行35个循环;72℃延伸8min;4℃最终保存;S5,PCR扩增产物先进行引物初步筛选,然后再进行多态性筛选,根据谱带的有无和大小来判定结果。本发明需要解决的关键技术是EST‑SSR标记引物的获得和筛选,以及PCR扩增体系的优化。
搜索关键词: 利用 转录 组测序 ssr 分子 标记 鉴定 火龙果 种质 方法
【主权项】:
一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定火龙果种质的方法,其特征在于:EST‑SSR标记引物为如下表的1对或任意几对:
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