[发明专利]一种基于全准同重二乙基标记的蛋白质定量方法在审
申请号: | 201710307287.6 | 申请日: | 2017-05-04 |
公开(公告)号: | CN106990159A | 公开(公告)日: | 2017-07-28 |
发明(设计)人: | 田志新;栗云慧;肖开捷 | 申请(专利权)人: | 同济大学 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司31225 | 代理人: | 褚明伟 |
地址: | 200092 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于全准同重二乙基标记的蛋白质定量方法,首先将两组不同生理或病理条件的整体蛋白分别作为控制组与疾病组;再将控制组蛋白质与疾病组蛋白质任意位置赖氨酸及N端氨基酸上的所有氨基进行全同重二乙基标记,分别标记为‑N(13CH313CHD)2和‑N(CD3CH2)2;同重标记后两组蛋白按等比例混合进行高分辨质谱和串级质谱分析得到一个数据组;对数据组进行定性、定量数据库搜索,得到蛋白质的ID及疾病组每一个蛋白质相对于控制组的相对比例,即疾病条件下所有蛋白的上调或下调情况,上调或下调倍数最大的蛋白即为与该疾病发生、发展相关的蛋白。与现有技术相比,本发明方法标记效率高,准确度高,适用于整体蛋白质基于高分辨串级质谱的定量分析。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 乙基 标记 蛋白质 定量 方法 | ||
【主权项】:
一种基于全准同重二乙基标记的蛋白质定量方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)将两组不同生理或病理条件的整体蛋白分别作为控制组与疾病组;(2)将还原及烷基化后的控制组蛋白质与疾病组蛋白质任意位置赖氨酸及N端氨基酸上的所有氨基进行全同重二乙基标记,分别标记为‑N(13CH313CHD)2和‑N(CD3CH2)2,其质量差异为11.68mDa;(3)同重标记后两组蛋白按等比例混合进行高分辨质谱和串级质谱分析得到一个数据组;(4)对数据组进行定性、定量数据库搜索,得到蛋白质的ID及疾病组每一个蛋白质相对于控制组的相对比例,即疾病条件下所有蛋白的上调或下调情况,上调或下调倍数最大的蛋白即为与该疾病发生、发展相关的蛋白。
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