[发明专利]一种人类HLA区域基因拷贝数变异检测方法在审
申请号: | 201710192464.0 | 申请日: | 2017-03-28 |
公开(公告)号: | CN106967801A | 公开(公告)日: | 2017-07-21 |
发明(设计)人: | 华子昂;万君兴;王翠芳;万金营;孙宁;竹添;钭理强 | 申请(专利权)人: | 华子昂 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 银川长征知识产权代理事务所64102 | 代理人: | 陈晓庆 |
地址: | 116000 辽宁省大连市*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | 本发明公开了一种人类HLA区域基因拷贝数变异检测方法,该方法首先采集人的组织、血液或其他体液基因组作为样品,将样品与CytoscanHD芯片进行杂交,杂交完成后对芯片进行洗涤,然后在GCD3000系统的数据收集系统中进行数据收集,生成CEL文件;然后将CEL文件输入CHAS软件进行初级质控,将质控合格的芯片生成的Cychp文件导入CHAS软件,根据拷贝数特征、marker数量以及CNV gain和CNV loss片段大小三个指标筛选出目的marker。本发明运用CytoscanHD芯片精确检测拷贝数变异的能力和结合CHAS软件直观且简化的分析流程,并通过对CHAS软件区间的特定设置,大大提高了检测HLA区域拷贝数变异的准确率,得到的数据更加可靠、真实,为预防习惯性流产和产前诊断得到了重要的保障。 | ||
搜索关键词: | 一种 人类 hla 区域 基因 拷贝 变异 检测 方法 | ||
【主权项】:
一种人类HLA区域基因拷贝数变异检测方法,其特征在于:包括如下步骤:(1)采集人的组织、血液或其他体液基因组作为样品,将样品与CytoscanHD芯片进行杂交,杂交完成后对芯片进行洗涤,然后在GCD3000系统的数据收集系统中进行数据收集,生成CEL文件;(2)将CEL文件输入CHAS软件进行初级质控,将质控合格的芯片生成的Cychp文件导入CHAS软件,根据拷贝数特征、marker数量以及CNV gain和CNV loss片段大小三个指标筛选出目的marker。
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