[发明专利]一种可进行多物种分子标记的单引物及其标记方法有效
申请号: | 201710184205.3 | 申请日: | 2017-03-24 |
公开(公告)号: | CN106906289B | 公开(公告)日: | 2017-12-19 |
发明(设计)人: | 熊发前;刘俊仙;唐荣华;贺梁琼;韩柱强;蒋菁;钟瑞春;唐秀梅;杨行海;严华兵;吴建明;陈华;黄志鹏;吴海宁;周慧文;庄伟建;高轶静;丘立杭;罗赛云;史卫东;邹成林 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司11340 | 代理人: | 但玉梅 |
地址: | 530007 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明涉及生物技术领域,特别涉及一种可进行多物种分子标记的单引物及其标记方法,该引物根据真核生物基因组中基因内含子区域或调控区域富含AT设计,引物序列长度为17bp,其中,填充序列为富含GC碱基的任意序列,核心区序列由AT碱基随机排列组成,选择性碱基序列为任意碱基序列,引物可以在真核生物间通用,大大减少了引物的合成费用,也大大地提高了引物的利用率;同时,本发明的DNA分子标记方法是基于PCR反应的,多态性始于内含子序列变异及插入/缺失,该方法简单高效、多态性高、扩增条带数量丰富、结果可靠、条带易于分离及可测序等。 | ||
搜索关键词: | 一种 进行 物种 分子 标记 引物 及其 方法 | ||
【主权项】:
一种可进行多物种分子标记的单引物,其特征在于,所述单引物根据真核生物基因组中基因内含子区域或调控区域富含AT设计,单引物序列长度为17bp;所述引物序列由核心序列和选择性碱基序列组成,所述核心序列由从5’端到3’端的14个碱基组成,包括填充序列和核心区序列,其中,从5’端到3’端的第1‑第6个碱基为填充序列,从5’端到3’端的第7‑第14个碱基为核心区序列;所述选择性碱基序列由3个碱基组成,为从5’端到3’端的第15‑第17个碱基;所述填充序列为富含GC碱基的任意序列;所述核心区序列由AT碱基随机排列组成;所述选择性碱基序列为任意碱基序列;所述单引物序列为Mem1‑Mem32中的任意一条:Mem1:5’‑GCCGGCATTATTATCCA‑3’;Mem2:5’‑GCCGGCATTATTATCCC‑3’;Mem3:5’‑GCCGGCATTATTATCCG‑3’;Mem4:5’‑GCCGGCATTATTATCCT‑3’;Mem5:5’‑GCCGGCATTATTATCGA‑3’;Mem6:5’‑GCCGGCATTATTATCGC‑3’;Mem7:5’‑GCCGGCATTATTATCGG‑3’;Mem8:5’‑GCCGGCATTATTATCGT‑3’;Mem9:5’‑GCCGGCATTATTATGGA‑3’;Mem10:5’‑GCCGGCATTATTATGGC‑3’;Mem11:5’‑GCCGGCATTATTATGGG‑3’;Mem12:5’‑GCCGGCATTATTATGGT‑3’;Mem13:5’‑GCCGGCATTATTATGCA‑3’;Mem14:5’‑GCCGGCATTATTATGCC‑3’;Mem15:5’‑GCCGGCATTATTATGCG‑3’;Mem16:5’‑GCCGGCATTATTATGCT‑3’;Mem17:5’‑GGCGCCAATAATAACCA‑3’;Mem18:5’‑GGCGCCAATAATAACCC‑3’;Mem19:5’‑GGCGCCAATAATAACCG‑3’;Mem20:5’‑GGCGCCAATAATAACCT‑3’;Mem21:5’‑GGCGCCAATAATAACGA‑3’;Mem22:5’‑GGCGCCATTATTATCGC‑3’;Mem23:5’‑GGCGCCAATAATAACGG‑3’;Mem24:5’‑GGCGCCAATAATAACGT‑3’;Mem25:5’‑GGCGCCAATAATAAGGA‑3’;Mem26:5’‑GGCGCCAATAATAAGGC‑3’;Mem27:5’‑GGCGCCAATAATAAGGG‑3’;Mem28:5’‑GGCGCCAATAATAAGGT‑3’;Mem29:5’‑GGCGCCAATAATAAGCA‑3’;Mem30:5’‑GGCGCCAATAATAAGCC‑3’;Mem31:5’‑GGCGCCAATAATAAGCG‑3’;Mem32:5’‑GGCGCCAATAATAAGCT‑3’;所述单引物适用于真核生物的分子标记分析;所述真核生物为花生、水稻、玉米、甘蔗、木薯、菜心和真菌中的任意一种。
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