[发明专利]一种可进行多物种分子标记的单引物及其标记方法有效
申请号: | 201710184205.3 | 申请日: | 2017-03-24 |
公开(公告)号: | CN106906289B | 公开(公告)日: | 2017-12-19 |
发明(设计)人: | 熊发前;刘俊仙;唐荣华;贺梁琼;韩柱强;蒋菁;钟瑞春;唐秀梅;杨行海;严华兵;吴建明;陈华;黄志鹏;吴海宁;周慧文;庄伟建;高轶静;丘立杭;罗赛云;史卫东;邹成林 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司11340 | 代理人: | 但玉梅 |
地址: | 530007 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 进行 物种 分子 标记 引物 及其 方法 | ||
1.一种可进行多物种分子标记的单引物,其特征在于,所述单引物根据真核生物基因组中基因内含子区域或调控区域富含AT设计,单引物序列长度为17bp;所述引物序列由核心序列和选择性碱基序列组成,所述核心序列由从5’端到3’端的14个碱基组成,包括填充序列和核心区序列,其中,从5’端到3’端的第1-第6个碱基为填充序列,从5’端到3’端的第7-第14个碱基为核心区序列;所述选择性碱基序列由3个碱基组成,为从5’端到3’端的第15-第17个碱基;所述填充序列为富含GC碱基的任意序列;所述核心区序列由AT碱基随机排列组成;所述选择性碱基序列为任意碱基序列;
所述单引物序列为Mem1-Mem32中的任意一条:
Mem1:5’-GCCGGCATTATTATCCA-3’;
Mem2:5’-GCCGGCATTATTATCCC-3’;
Mem3:5’-GCCGGCATTATTATCCG-3’;
Mem4:5’-GCCGGCATTATTATCCT-3’;
Mem5:5’-GCCGGCATTATTATCGA-3’;
Mem6:5’-GCCGGCATTATTATCGC-3’;
Mem7:5’-GCCGGCATTATTATCGG-3’;
Mem8:5’-GCCGGCATTATTATCGT-3’;
Mem9:5’-GCCGGCATTATTATGGA-3’;
Mem10:5’-GCCGGCATTATTATGGC-3’;
Mem11:5’-GCCGGCATTATTATGGG-3’;
Mem12:5’-GCCGGCATTATTATGGT-3’;
Mem13:5’-GCCGGCATTATTATGCA-3’;
Mem14:5’-GCCGGCATTATTATGCC-3’;
Mem15:5’-GCCGGCATTATTATGCG-3’;
Mem16:5’-GCCGGCATTATTATGCT-3’;
Mem17:5’-GGCGCCAATAATAACCA-3’;
Mem18:5’-GGCGCCAATAATAACCC-3’;
Mem19:5’-GGCGCCAATAATAACCG-3’;
Mem20:5’-GGCGCCAATAATAACCT-3’;
Mem21:5’-GGCGCCAATAATAACGA-3’;
Mem22:5’-GGCGCCATTATTATCGC-3’;
Mem23:5’-GGCGCCAATAATAACGG-3’;
Mem24:5’-GGCGCCAATAATAACGT-3’;
Mem25:5’-GGCGCCAATAATAAGGA-3’;
Mem26:5’-GGCGCCAATAATAAGGC-3’;
Mem27:5’-GGCGCCAATAATAAGGG-3’;
Mem28:5’-GGCGCCAATAATAAGGT-3’;
Mem29:5’-GGCGCCAATAATAAGCA-3’;
Mem30:5’-GGCGCCAATAATAAGCC-3’;
Mem31:5’-GGCGCCAATAATAAGCG-3’;
Mem32:5’-GGCGCCAATAATAAGCT-3’;
所述单引物适用于真核生物的分子标记分析;
所述真核生物为花生、水稻、玉米、甘蔗、木薯、菜心和真菌中的任意一种。
2.根据权利要求1所述的一种可进行多物种分子标记的单引物,其特征在于,所述单引物的解链温度为51℃-61℃。
3.应用权利要求1-2任意一项所述单引物进行多物种分子标记的标记方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)按所述序列合成单引物;
(2)提取真核生物的基因组DNA,得到基因组DNA模板;
(3)利用步骤(1)的单引物与步骤(2)的基因组DNA模板在PCR扩增反应体系中进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
(4)将步骤(3)的PCR扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,再通过溴化乙锭染色,在凝胶成像系统下拍照、保存图像和记录结果。
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