[发明专利]一种虾仁低温贮藏过程中特定腐败菌的PCR‑DGGE分析方法在审
申请号: | 201710169421.0 | 申请日: | 2017-03-21 |
公开(公告)号: | CN106811538A | 公开(公告)日: | 2017-06-09 |
发明(设计)人: | 彭志兰;王萍亚;郭海波;黄朱梁;孙瑛 | 申请(专利权)人: | 舟山市食品药品检验检测研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 杭州千克知识产权代理有限公司33246 | 代理人: | 朱如松 |
地址: | 316021 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明涉及生物技术工程领域,具体涉及一种虾仁低温贮藏过程中特定腐败菌的PCR‑DGGE分析方法。该方法按以下步骤进行虾仁样品的预处理及菌体收集;虾仁样品中微生物总DNA的提取;以提取的微生物的总DNA为模板,进行16SrRNA的PCR扩增;将PCR产物在进行DGGE电泳分析,电泳结束后染色、扫描仪成像,在PCR‑DGGE图谱上标记特异性条带,切胶回收,最后在NCBI数据库进行Blast比对,获得虾仁低温贮藏过程中细菌多样性以及特定腐败菌的信息。该方法可以用于虾仁保鲜或者低温贮藏过程中主要菌群尤其是特定腐败菌群的分析,可避免传统分离培养的耗时大,工作繁重,操作繁琐,实现对虾仁样品中菌群总DNA的高效提取、有效扩增以及菌群微生态及特定腐败菌准确分析。 | ||
搜索关键词: | 一种 虾仁 低温 贮藏 过程 特定 腐败 pcr dgge 分析 方法 | ||
【主权项】:
一种虾仁低温贮藏过程中特定腐败菌的PCR‑DGGE分析方法,其特征在于,按以下步骤进行:(1)、虾仁样品的预处理及菌体收集;(2)、提取虾仁样品中微生物总DNA;(3)、以提取的微生物总DNA为模板,进行细菌16S rRNA的PCR扩增,并检测;(4)、将PCR产物进行DGGE电泳分析;电泳结束后染色、扫描仪成像,得到DGGE图谱,在图谱上标记特异条带,切胶回收;(5)、回收的DNA条带重新进行PCR扩增,然后测序,将测得的序列结果在NCBI数据库进行Blast同源性比对分析,确定细菌的归属,然后根据在DGGE图谱上标记的条带情况与鉴定出的细菌种类进行分析。
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