[发明专利]高噪声样品中原位检测核苷酸变体及相关的组合物和方法

摘要

本发明涉及原位检测样品中目标核酸的核酸变异的方法，包括单核苷酸变异、多核苷酸变异或剪接位点。所述方法可以包括如下步骤：使所述样品与检测所述核酸变异或剪接位点的探针以及邻居探针接触；使所述样品与结合所述核酸变异探针或剪接位点探针以及邻居探针的前级放大子接触；以及使所述样品与标签探针系统接触；其中组分的杂交形成信号发生复合物(SGC)，其包含具有所述核酸变异或剪接位点的目标核酸、探针和放大子；以及原位检测所述样品上来自所述SGC的信号。

主权项

1.一种原位检测固定和透性化细胞的样品中目标核酸的单核苷酸变异的方法，包括：(A)使所述样品与单核苷酸变异探针(SP)和邻近探针(NP)接触，其中所述SP包含可以与包含所述单核苷酸变异的目标核酸区域特异性杂交的目标锚定片段(SPAT)和前级放大子锚定片段(SPAP)，以及其中所述NP包含可以与邻近所述SP的结合位点的目标核酸区域杂交的目标锚定片段(NPAT)和前级放大子锚定片段(NPAP)；(B)使所述样品与SP前级放大子(SPM)和NP前级放大子(NPM)接触，其中所述SPM包含可以结合所述SP的片段并包含两个或更多个SP协作锚(SPCA)，和其中所述NPM包含可以结合所述NP的片段并包含两个或更多NP协作锚(NPCA)；(C)使所述样品与协作放大子(COM)接触，其中所述COM包含与所述SPCA互补的第一片段、与所述NPCA互补的第二片段、和包含多个标签放大子锚定片段的第三片段；(D)使所述样品与标签探针系统(LPS)接触，其中所述LPS包含多个标签放大子(LM)和多个标签探针(LP)，其中每个LM包含可以结合所述COM的标签放大子锚定片段的片段以及多个标签探针锚定片段，其中每个LP包含可检测标签和与LM的所述标签探针锚定片段杂交的片段，其中上述杂交形成信号发生复合物(SGC)，其包含具有所述单核苷酸变异的目标核酸、SP、NP、SPM、NPM、多个COM、多个LM和多个LP；和(E)原位检测所述样品上来自所述SGC的信号。