[发明专利]评估胎儿样本中母体细胞污染程度的方法有效

专利信息
申请号: 201410637811.2 申请日: 2014-11-13
公开(公告)号: CN105586392B 公开(公告)日: 2021-04-20
发明(设计)人: 赵素敏;易玉婷;宋炎;吴仁花;易鑫 申请(专利权)人: 天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6876 分类号: C12Q1/6876;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 李志东
地址: 300308 天津市滨海新区空港经济区*** 国省代码: 天津;12
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摘要: 发明公开了一种检测胎儿核酸样本中是否含有母体核酸的方法,包括:获得胎儿核酸样本和母体的核酸样本,所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本各自包含DNA片段;分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与以下21个参考SNP中的至少5个对应的位点的碱基类型:rs1057079、rs3890011、rs13007735、rs10172036、rs2516835、rs1656922、rs2686817、rs11167136、rs70156、rs2275111、rs2293277、rs2292681、rs3742302、rs4981088、rs11737、rs7169981、rs3115438、rs2302836、rs1455556、rs2235862和rs2296241;基于比较所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的对应于相同所述参考SNP的位点的碱基类型的差异,判断所述胎儿核酸样本中是否含有所述母体核酸。
搜索关键词: 评估 胎儿 样本 母体 细胞 污染 程度 方法
【主权项】:
一种检测胎儿核酸样本中是否含有母体核酸的方法,所述母体核酸来自怀有所述胎儿的母亲,所述方法包括以下步骤,(a)获得所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本,所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本各自包含DNA片段,以及任选的获得父本核酸样本,所述父本核酸样本来自所述胎儿的父亲,所述父本核酸样本包含DNA片段;(b)分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与以下21个参考SNP中的至少5个对应的位点的碱基类型:rs1057079、rs3890011、rs13007735、rs10172036、rs2516835、rs1656922、rs2686817、rs11167136、rs70156、rs2275111、rs2293277、rs2292681、rs3742302、rs4981088、rs11737、rs7169981、rs3115438、rs2302836、rs1455556、rs2235862和rs2296241,任选的检测所述父本核酸样本中的DNA片段中的与所述胎儿核酸样本和/或所述母体的核酸样本中的所述位点对应的位点的碱基类型;(c)基于比较(b)步骤中检测的所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本以及任选的所述父本核酸样本中的DNA片段中的对应于所述参考SNP的位点的碱基类型的差异,判断所述胎儿核酸样本中是否含有所述母体核酸;任选地,(b)步骤中,分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与所述21个参考SNP中的至少10个对应的位点的碱基类型;任选地,(b)步骤中,分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与所述21个参考SNP中的至少15个对应的位点的碱基类型;任选地,(b)步骤中,分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与所述21个所述参考SNP中的至少20个对应的位点的碱基类型;任选地,(b)步骤中,分别检测所述胎儿核酸样本和所述母体的核酸样本中的DNA片段中的与所述21个参考SNP对应的位点的碱基类型。
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