[发明专利]结直肠癌症治疗预后生物标记物的筛选方法

摘要

本发明公开了一种结直肠癌症治疗预后生物标记物的筛选方法，包括以下步骤：1）制定初步筛选生物标记物的检索策略；2）制定文献采纳与排除标准；3）数据分析与生物标记物的初步筛选；4）制定证据的级别；5）制定高质量证据评判标准；6）生物标记物临床证据的分级检索与质量评估；7）生物标记物临床证据数据分析与统计；8）治疗预后标记物筛选。本发明还同时提供了利用上述方法筛选而得的结直肠癌症治疗预后生物标记物，为KRAS、TYMS、TYMS、EGFR、UGT1A1*28、DPYD、PIK3CA、ERCC1、PTEN、VEGFR、BRAF、GST P1、XRCC1、MTHFR、MSI等。

主权项

结直肠癌症治疗预后生物标记物的筛选方法，其特征是包括以下步骤： 1）、制定初步筛选生物标记物的检索策略：根据PICOS原则确定检索词，并采用布林连接符式的主题词索引；利用检索词在数据库包括MEDLINE，EMBASE，Cochrane，TRIP,维普（CPVIP），中国生物医学期刊文献数据库（CMDisc），万方数据库和中国知识资源总库（CNKI）中全面检索文献；检查纳入文献的参考文献，如果使用了相同的研究对象，选取样本量最大的或者包含的所有相同研究对象的研究； 2）、制定文献采纳与排除标准：依据文献采纳与排除标准，筛选符合标准的文献摘要；采纳标准：①研究必须是以人为研究对象进行的临床研究；②研究必须有治疗干预手段；③研究内容必须探索了治疗相关的一种或几种生物标记物；④临床疗效必须是客观生存期、药物反应率或不良反应；⑤只纳入前瞻性和回顾性研究；排除标准：①与医学实践无直接关系的分子、细胞和动物的基础医学研究；②研究样本量＜20例；3）、数据分析与生物标记物的初步筛选：根据符合标准的文献摘要，初步分析文献研究类型以及纳入研究的病人的特征、治疗方案、测量效果的结局指标、结局的观察时间，分析不同文献质量、不同治疗手段、不同治疗结果、不同研究类型的生物标记物分布规律，构建生物标记物库；在库中筛选生物标记物符合以下标准之一：①证据中有系统综述文献；②证据中有随机对照试验研究文献；③证据中队列研究文献数量≥5篇；4）、制定证据的级别：根据结直肠癌治疗预后生物标记物的证据类别，将证据分级如下：证据级别    证据要求1 a        包含多个同质随机对照试验的系统综述；1 b        至少一个随机对照试验；2 a        包含多个同质队列研究的系统综述；2 b        至少一个队列研究；5）、 制定高质量证据评判标准：参照Newcastle‑Ottawa Scale标准对4级不同的文献研究类型制定高质量证据的评判标 准；6）、 生物标记物临床证据的分级检索与质量评估：生物标记物临床证据检索依从证据级别1a＞1b＞2a＞2b，以随机对照试验的系统综述、随机对照试验、系统综述、所有相关研究检索式的顺序检索初筛中的生物标记物相关临床证据，纳入符合文献采纳与排除标准的临床证据，再根据高质量证据评判标准对纳入的临床证据进行质量评估；7）、生物标记物临床证据数据分析与统计：只对生物标记物高质量的临床证据进行数据分析与统计，当证据1a,2a类中只有一篇系统综述时，该证据直接被纳入；当出现多篇系统综述时：（1）如果结果一致显著或一致不显著，纳入所有系统综述；（2）结果不一致时，需考虑单篇系统综述纳入研究的原始文献范围及数量、试验设计的方案、研究人群特征、统计方法等差异，选择纳入的系统综述满足标准：①样本较多；②试验设计更合理；证据1b,2b中只有一篇系统综述时，该证据直接被纳入；当出现多篇研究，使用meta分析合并结果， Q‑test评价异质性，并以亚组分析查找异质性来源，以Begg’s漏斗图检验发表偏倚；合并结果指标纳入证据库；8）、治疗预后标记物筛选：从纳入的证据中筛选结果OS、PFS、复发、毒性等预后指标显著（p＜0.05），无发表偏倚（p>0.05）的生物标记物。