[发明专利]尿毒症长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型及其构建方法有效
申请号: | 201110181725.1 | 申请日: | 2011-06-30 |
公开(公告)号: | CN102286464A | 公开(公告)日: | 2011-12-21 |
发明(设计)人: | 眭维国;戴勇;刘娟 | 申请(专利权)人: | 眭维国 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 541002 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明涉及一种尿毒症外周血单核细胞长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型的构建方法,其包括以下步骤:A1、获取尿毒症患者组与正常对照组的离体的测试外周血样本,对各所述测试外周血样本,分别获取基因芯片数据;A2、将各所述测试外周血样本的基因芯片数据上传到基因芯片数据分析软件,并设置归一化基准以及数据滤过的比值倍数,获取差异表达基因,得到尿毒症外周血单核细胞长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型。上述方案,为研究尿毒症提供了作为中间结果的信息,并且为进一步揭示尿毒症的病理机制提供了新思路。此外,本发明还涉及一种尿毒症长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型。 | ||
搜索关键词: | 尿毒症 长链非 编码 核糖核酸 差异性 表达 图谱 模型 及其 构建 方法 | ||
【主权项】:
一种尿毒症外周血单核细胞长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:A1、获取尿毒症患者组与正常对照组的离体的测试外周血样本,对各所述测试外周血样本,分别获取基因芯片数据,具体执行以下步骤:A11、采用生理盐水对倍稀释全血,再缓慢加入至等体积的淋巴细胞缓冲液;A12、以800×g水平离心30分钟后,吸取单个核细胞,用生理盐水清洗两次,吸除管底沉淀细胞上的液体,加入1mL总RNA提取试剂吹打混匀后置于零下80摄氏度保存;A13、采用总RNA提取试剂抽提RNA,通过硅胶膜纯化法获得纯化的RNA;A14、使用超微量核酸蛋白测定仪分别测定RNA在230nm、260nm、280nm波长下的吸收值,计算RNA浓度以评估RNA纯度,并使用甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度和完整性;A15、使用双链互补DNA合成试剂盒,将获得的RNA合成双链互补DNA,使用单色DNA标记试剂盒进行标记;A16、使用芯片杂交系统对标记后的双链互补DNA进行排列杂交,得到杂交芯片,采用匹配的清洗试剂盒清洗杂交芯片;A17、使用芯片扫描仪扫描清洗后的杂交芯片的荧光强度,使用635nm激发,获得芯片扫描图像后,使用生物芯片扫描分析软件进行数据分析,导出格式化微阵列文本数据作为所述基因芯片数据;A2、将各所述测试外周血样本的基因芯片数据上传到基因芯片数据分析软件,并设置归一化基准以及数据滤过的比值倍数,获取差异表达基因,得到尿毒症外周血单核细胞长链非编码核糖核酸差异性表达图谱模型。
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