[发明专利]对宏基因组16S高可变区V6进行测序聚类分析的方法无效
| 申请号： | 201010557119.0 | 申请日： | 2010-11-24 |
| 公开（公告）号： | CN102477460A | 公开（公告）日： | 2012-05-30 |
| 发明（设计）人： | 刘晓;周宏伟;栗东芳 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人： | 程泳 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开一种对宏基因组16S高可变区V6进行测序聚类分析的方法，该方法包括：提取微生物DNA；通过引物对宏基因组16S rDNA的高可变区V6进行PCR，并为每个样品加上标签序列；把不同样品的PCR产物进行混合；对混合后的PCR产物进行Solexa建库法建库；使用Solexa测序工具对高可变区V6的文库进行双末端pair-end测序，得到原始的测序数据；对测序数据进行筛选，以过滤掉低质量的数据；利用重叠群的关系对高可变区V6的全长序列进行组装；通过标签序列把reads分配到对应的样品上；通过对reads进行分类分析，以实现使用高可变区的测序对微生物群体进行高通量和精准的分类。 | ||
| 搜索关键词： | 宏基 16 可变 v6 进行 聚类分析 方法 | ||
【主权项】：
一种对宏基因组16S高可变区V6进行测序聚类分析的方法，其特征在于，所述方法包括：提取微生物的脱氧核糖核酸DNA；通过引物对宏基因组16S核糖体脱氧核糖核酸rDNA的高可变区V6进行聚合酶链式反应PCR，并为每个样品加上标签序列；把不同样品的PCR产物进行混合；对混合后的PCR产物进行Solexa建库法建库；使用Solexa测序工具对所述高可变区V6的文库进行双末端pair‑end测序，得到原始的测序数据；对所述测序数据进行筛选，以过滤掉低质量的数据；利用重叠群的关系对所述高可变区V6的全长序列进行组装；通过标签序列把reads分配到对应的样品上；通过对所述reads进行分类分析，以实现使用所述高可变区的测序对微生物群体进行高通量的分类。
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