[发明专利]一种c-KIT基因突变检测液相芯片

摘要

本发明公开了一种c-KIT基因突变检测液相芯片，主要包括有：5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物，所述特异性引物是：针对AY502-503dup突变位点的SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11、针对V560G突变位点的SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.13、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.15、和/或针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.16及SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.9；分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球；扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％。所制备的c-KIT基因突变检测液相芯片具有很好的信号-噪声比，并可实现多个突变位点的并行检测。

主权项

一种c‑KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，主要包括有：(A)针对c‑KIT基因的突变位点，分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成，所述特异性引物是：针对AY502‑503dup突变位点的SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11、针对V560G突变位点的SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.13、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.15、和/或针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.16及SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.9；(B)分别包被有特异的anti‑tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.19～SEQ ID NO.27中的序列，所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；(C)用于扩增具有AY502‑503dup、V560G、T670I、和/或D816H/V的突变位点的c‑KIT基因目标序列的扩增引物。