[发明专利]一种c-KIT基因突变检测液相芯片

权利要求书

1.一种c-KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，主要包括有：

(A)针对c-KIT基因的突变位点，分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成，所述特异性引物是：针对AY502-503dup突变位点的SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11、针对V560G突变位点的SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.13、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.15、和/或针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.16及SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.9；

(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.19～SEQ ID NO.27中的序列，所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；

(C)用于扩增具有AY502-503dup、V560G、T670I、和/或D816H/V的突变位点的c-KIT基因目标序列的扩增引物。

2.根据权利要求1所述的c-KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为：针对AY502-503dup和V560G突变位点的SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31、和/或针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33。

3.根据权利要求1或2所述的c-KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，

(A)ASPE引物对为：针对AY502-503dup突变位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.11组成的序列、针对V560G突变位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.12组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.13组成的序列、针对T670I突变位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.14组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.15组成的序列、和/或针对D816H/V突变位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.16组成的序列、由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.17组成的序列及由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.18组成的序列。

4.根据权利要求3所述的c-KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，

(A)ASPE引物对为：针对AY502-503dup突变位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.11组成的序列、针对V560G突变位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.12组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.13组成的序列、针对T670I突变位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.14组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.15组成的序列、和针对D816H/V突变位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.16组成的序列、由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.17组成的序列及由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.18组成的序列；

(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.19～SEQ ID NO.27中的序列，所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；

(C)所述扩增引物为：针对AY502-503dup和V560G突变位点的SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29、针对T670I突变位点的SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31、和针对D816H/V突变位点的SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33。

5.根据权利要求1所述的c-KIT基因突变检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂序列为5-10个T。