[发明专利]一种培养筛选微生物菌种的方法

摘要

本发明公开了一种培养筛选微生物菌种的方法，先通过提取各样品的总基因组，再利用PCR技术及RFLP分子生物学技术检测物样品中微生物的种类、丰度、生物多样性及其分布规律，用能谱仪分析样品的矿物元素的成份，并结合取样时获得的取样点的理化信息构建针对样品中各类微生物的个性化富集培养体系，以个性化富集培养体系来筛选分离样品中各类微生物，特别是目的微生物。与传统的选择性微生物筛选培养方法相比，本发明使得一些不可培养的微生物变成可培养的；克服了损失新种概率大、样品耗量大、随机性与盲目性程度高、效率低等问题，提高了从样品培养和选育微生物的产率和种类。

主权项

1.一种培养筛选微生物菌种的方法，其特征在于包括以下步骤：1)样品处理及DNA抽提：溶解洗涤样品，收集菌体颗粒物质，去杂质，收集沉淀物；酚-氯仿-异戊醇抽提沉淀物中的DNA；2)PCR扩增，克隆、酶切、测序及序列分析，检测样品中微生物种类多样性：分别采用细菌、古细菌和真菌通用引物扩增DNA抽提物，扩增产物，纯化，纯化产物连接克隆后通过蓝白筛选阳性克隆子；对阳性克隆子进行克隆序列的扩增，扩增产物经酶切电泳后初步判断样品中所含微生物的种类数；对各种类进行测序分析，获知样品中的微生物种类、丰度、生物多样性和分布规律；3)微生物菌种的个性化富集培养：用扫描电镜分析样品的表面形态结构；用能谱仪、X-射线采集样品矿物元素的成份及其有机物种类的信息；采集样品所在的环境信息，包括温度、酸碱度、盐度等；通过序列比对分析，初步判断各类微生物的种属及生长特征情况，参照已有的该类微生物的相关信息；对于新种则参照与之在系统发育树中亲缘关系最近的微生物的生长环境信息；根据上述信息建立个性化富集培养体系；应用个性化富集培养体系富集各类微生物，分离纯化各富集分离物，获得纯培养物。