[发明专利]多样性合成肽和多肽文库的设计和构建有效

专利信息
申请号: 200780044613.3 申请日: 2007-09-28
公开(公告)号: CN101548034A 公开(公告)日: 2009-09-30
发明(设计)人: 劳伦斯·霍罗威茨;拉梅什·R·巴特;阿伦·L·库尔茨曼 申请(专利权)人: 航道生物技术有限责任公司
主分类号: C40B50/02 分类号: C40B50/02;G06F19/00;C07K16/00
代理公司: 北京市柳沈律师事务所 代理人: 罗天乐
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明涉及多样性肽和多肽文库的设计和构建。具体而言,本发明涉及使用多重相关参数作为过滤器创建数据集的分析数据库设计方法;还涉及通过定向多重合成寡核苷酸合成(directed multisyntheses oligonucleotide synthesis)来生成序列多样性的方法。本发明使得人们能够基于可个别直接限定的单一或多重相关关键参数,将大型、复杂的附注释的数据库简化成更简单的相关序列数据集。所述方法还使得人们能够基于这种方法,使用离散和简并寡核苷酸的多重合成群集来捕获多种多样的序列群集或其部分,来生成多样性文库。
搜索关键词: 多样性 合成 多肽 文库 设计 构建
【主权项】:
1. 一种用于数据库多样性分析的方法,所述数据库包含以至少一个共享序列基序为特征的相关氨基酸序列,所述方法包括如下步骤:(a)对所述相关氨基酸序列进行比对;(b)通过对所述包含共享序列基序的相关氨基酸序列应用预定的两个或更多个过滤器的组合来创建第一数据集;(c)分析所述第一数据集在所述共享序列基序内的位置氨基酸使用频率;和(d)创建以在所述共享序列基序内的一个或多个氨基酸位置处的最小阈值氨基酸使用频率为特征的第二数据集。
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