[发明专利]一种丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统及其构建方法在审
| 申请号: | 202310403822.3 | 申请日: | 2023-04-17 |
| 公开(公告)号: | CN116555316A | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
| 发明(设计)人: | 黄和;施天穹;郭琪;张驰;徐晴 | 申请(专利权)人: | 南京师范大学 |
| 主分类号: | C12N15/80 | 分类号: | C12N15/80;C12N15/66;C12R1/685;C12R1/68;C12R1/645 |
| 代理公司: | 西安杜诺匠心专利代理事务所(普通合伙) 61272 | 代理人: | 苏雪雪 |
| 地址: | 210046 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 丝状 真菌 通用 crispr cas9 编辑 系统 及其 构建 方法 | ||
1.一种丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
获取丝状真菌H2B定位信号和5sRNA启动子的核苷酸序列;
将丝状真菌H2B作为模板设计引物FFH2B-F和FFH2B-R,并PCR扩增出带有同源臂的FFH2B表达框之后,利用内切酶SpeI将模板质粒pUC-Cas9-HPH酶切成线性片段,并将线性片段与所述带有同源臂的FFH2B表达框进行克隆和测序验证,获得重组质粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B,其中,所述模板质粒pUC-Cas9-HPH的核苷酸序列为SEQ ID NO.5所示;
将丝状真菌N20表达框作为模板设计引物FFN20-F和FFN20-R,并扩增出带有同源臂的FFN20表达框之后,利用内切酶KpnI将模板质粒pUCneo酶切成线性片段,并将线性片段与所述带有同源臂的FFN20表达框进行克隆和测序验证,获得重组质粒pUCneo-FfN20;
将所述重组质粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B与所述重组质粒pUCneo-FFN20同时转化到丝状真菌感受态细胞中,即可根据靶标基因进行编辑。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,根据NCBI获取所述丝状真菌H2B定位信号和所述5sRNA启动子的核苷酸序列。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌包括藤仓赤霉菌、烟曲霉、黑曲霉。
4.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为藤仓赤霉菌时,相匹配的引物FfH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示;相匹配的引物FfH2B-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示。
5.根据权利要求4所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物FfN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示;相匹配的引物FfN20-R的核苷酸序列为SEQ IDNO.8所示。
6.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为黑曲霉时,相匹配的引物AnH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.13所示;所述引物AnH2B-R的核苷酸序列为SEQID NO.14所示。
7.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物AnN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.16所示;相匹配的引物AnN20-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.17所示。
8.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为烟曲霉时,相匹配的引物AfH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.21所示;相匹配的引物AfH2B-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.22所示。
9.根据权利要求8所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物AfN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.24所示;相匹配的引物AfN20-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.25所示。
10.一种根据权利要求1-9所述方法构建的丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统。
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