[发明专利]一种丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统及其构建方法在审

专利信息
申请号: 202310403822.3 申请日: 2023-04-17
公开(公告)号: CN116555316A 公开(公告)日: 2023-08-08
发明(设计)人: 黄和;施天穹;郭琪;张驰;徐晴 申请(专利权)人: 南京师范大学
主分类号: C12N15/80 分类号: C12N15/80;C12N15/66;C12R1/685;C12R1/68;C12R1/645
代理公司: 西安杜诺匠心专利代理事务所(普通合伙) 61272 代理人: 苏雪雪
地址: 210046 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 丝状 真菌 通用 crispr cas9 编辑 系统 及其 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:

获取丝状真菌H2B定位信号和5sRNA启动子的核苷酸序列;

将丝状真菌H2B作为模板设计引物FFH2B-F和FFH2B-R,并PCR扩增出带有同源臂的FFH2B表达框之后,利用内切酶SpeI将模板质粒pUC-Cas9-HPH酶切成线性片段,并将线性片段与所述带有同源臂的FFH2B表达框进行克隆和测序验证,获得重组质粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B,其中,所述模板质粒pUC-Cas9-HPH的核苷酸序列为SEQ ID NO.5所示;

将丝状真菌N20表达框作为模板设计引物FFN20-F和FFN20-R,并扩增出带有同源臂的FFN20表达框之后,利用内切酶KpnI将模板质粒pUCneo酶切成线性片段,并将线性片段与所述带有同源臂的FFN20表达框进行克隆和测序验证,获得重组质粒pUCneo-FfN20;

将所述重组质粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B与所述重组质粒pUCneo-FFN20同时转化到丝状真菌感受态细胞中,即可根据靶标基因进行编辑。

2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,根据NCBI获取所述丝状真菌H2B定位信号和所述5sRNA启动子的核苷酸序列。

3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌包括藤仓赤霉菌、烟曲霉、黑曲霉。

4.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为藤仓赤霉菌时,相匹配的引物FfH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示;相匹配的引物FfH2B-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示。

5.根据权利要求4所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物FfN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示;相匹配的引物FfN20-R的核苷酸序列为SEQ IDNO.8所示。

6.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为黑曲霉时,相匹配的引物AnH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.13所示;所述引物AnH2B-R的核苷酸序列为SEQID NO.14所示。

7.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物AnN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.16所示;相匹配的引物AnN20-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.17所示。

8.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述丝状真菌选为烟曲霉时,相匹配的引物AfH2B-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.21所示;相匹配的引物AfH2B-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.22所示。

9.根据权利要求8所述的构建方法,其特征在于,相匹配的引物AfN20-F的核苷酸序列为SEQ ID NO.24所示;相匹配的引物AfN20-R的核苷酸序列为SEQ ID NO.25所示。

10.一种根据权利要求1-9所述方法构建的丝状真菌通用CRISPR/Cas9编辑系统。

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