[发明专利]CasФ编码基因、紧凑型植物基因组定向修饰系统及植物基因组表观编辑系统在审

专利信息
申请号: 202310263603.X 申请日: 2023-03-17
公开(公告)号: CN116463365A 公开(公告)日: 2023-07-21
发明(设计)人: 张勇;刘诗诗;唐旭;范婷婷;郑雪莲 申请(专利权)人: 电子科技大学
主分类号: C12N15/55 分类号: C12N15/55;C12N9/22;C12N9/10;C12N15/82;C12N15/64;A01H6/46;A01H5/00
代理公司: 成都极纬知识产权代理有限公司 51320 代理人: 梁鑫
地址: 611731 四川省成*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: cas 编码 基因 紧凑型 植物 基因组 定向 修饰 系统 表观 编辑
【权利要求书】:

1.一种CasФ核酸酶编码基因,其特征在于其核苷酸序列如Seq ID No.07所示,编码氨基酸序列如Seq ID No.12所述的CasФ核酸酶。

2.根据权利要求1所述的CasФ核酸酶编码基因,其特征在于:与转录激活元件的编码基因相连接;或者与甲基转移酶编码基因相连接;进一步的,所述的转录激活元件为TAL-VP128、VP64、2xTAD、2xTAD-VP64或VPR中的至少一种;或者所述甲基转移酶为Dnmt3A-Dnmt3L、Dnmt3A-Dnmt3L-KRAB或KRAB-Dnmt3A-Dnmt3L甲基转移酶中的至少一种;更进一步的,与转录激活元件或者甲基转移酶编码基因的连接通过链接序列进行,所述的链接序列为XTEN80、XTEN-3xFLAG、SGGSSGGS-XTEN-SGGSSGGS或6xGGGGS中的至少一种。

3.CasФ核酸酶蛋白表达单元,其特征在于所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元从5’到3’方向依次为:启动子-CasФ核酸酶编码基因-终止子;所述的CasФ核酸酶编码基因为权利要求1或2任一项所示。

4.根据权利要求6所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元,其特征在于:所述的启动子为PolII型启动子;进一步的,所述Pol II型启动子为ZmUbi1、OsUbi1、CaMV35S或AtUb10中的至少一种;或者,所述的终止子为Nos T、35s T、AtHSP T或pinII T中的至少一种;进一步的,CasФ核酸酶蛋白表达单元从5’到3’方向依次为启动子-NLS-CasФ-NLS-终止子,所述CasФ为CasФ核酸酶编码基因;再进一步的,CasФ核酸酶蛋白表达单元从5’到3’方向依次为ZmUbi1-NLS-CasФ-NLS-AtHSP T,所述CasФ为CasФ核酸酶编码基因。

5.根据权利要求6所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元,其特征在于:从5’到3’方向依次为启动子-NLS-CasФ-NLS-转录激活元件编码基因-终止子,或启动子-转录激活元件-NLS-CasФ-NLS-终止子;进一步的从5’到3’方向依次为ZmUbi1-NLS-CasФ-NLS-6TAL-VP128-AtHSP T,或ZmUbi1-6TAL-VP128-NLS-CasФ-NLS-AtHSP T。

6.根据权利要求5所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元,其特征在于:从5’到3’方向依次为启动子-KRAB-NLS-CasФ-NLS-链接序列-甲基转移酶编码基因-终止子,或启动子-甲基转移酶编码基因-链接序列-NLS-CasФ-KRAB-NLS-终止子;进一步的从5’到3’方向依次为ZmUbi1-KRAB-NLS-CasФ-NLS-XTEN-Dnmt3A-Dnmt3L-AtHSP T,或ZmUbi1-Dnmt3A-Dnmt3L-XTEN-NLS-CasФ-NLS-KRAB-AtHSP T。

7.CRISPR-CasФ植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:包括CasФ核酸酶蛋白表达单元和crRNA转录表达克隆单元两个结构单元;所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元为权利要求3~6任一项所述的CasФ核酸酶蛋白表达单元进一步的:所述的crRNA转录表达克隆单元从5’到3’方向依次为:启动子-核酶A编码序列-crRNA克隆单元的编码序列-核酶B编码区序列-终止子;更进一步的,所述crRNA转录表达克隆单元的启动子为Pol II型启动子;更进一步,所述的Pol II型启动子为ZmUbi1、OsUbi1、CaMV35S或AtUb10中的至少一种;或者,所述终止子为Nos T、35s T或HSP T中的至少一种;更进一步,所述的核酶A为I类内含子核酶、RNaseP、发夹状核酶、VS核酶、HH核酶或HDV核酶中的至少一种;或者所述的核酶B为I类内含子核酶、RNaseP、发夹状核酶、VS核酶、HH核酶或HDV核酶中的至少一种。

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