[发明专利]一种体液中高密度低丰度蛋白的检测方法在审
| 申请号: | 202310252276.8 | 申请日: | 2023-03-16 |
| 公开(公告)号: | CN116298011A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
| 发明(设计)人: | 官键;李楠 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学南方医院 |
| 主分类号: | G01N30/06 | 分类号: | G01N30/06;G01N30/08;G01N30/14;G01N30/72 |
| 代理公司: | 广东勰思律师事务所 44609 | 代理人: | 赵赛 |
| 地址: | 510000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 体液 中高 密度 低丰度 蛋白 检测 方法 | ||
1.一种体液中高密度低丰度蛋白的检测方法,其特征在于包括如下步骤:
S1)材料活化:利用活化剂对纳米级分子筛进行活化处理10-20min,所述活化剂包括按照重量百分数计的如下组分:乙腈0-20%、甲醇60-80%、乙醇0-30%、水0-40%;所述活化剂与纳米分子筛的质量比为10-6000:1;
S2)材料悬浊:将经过S1步骤处理过的纳米级分子筛加入第一缓冲液中,震荡形成悬浊液;所述纳米分子筛与第一缓冲液的质量比为1:1-100;
S3)检测样本孵育:将待检测的体液样本加入步骤S2得到的悬浊液中,混合均匀后在37±1℃的温度下震荡孵育5-30min,得到孵育液;所述体液样本与悬浊液的体积比为:V体液样本:V悬浊液=1:2-50;
S4)蛋白洗脱与酶解:将步骤S3得到的孵育液离心5-45min,弃上清,取沉淀物,将所述沉淀物加入第二缓冲液中并在90±5℃震荡孵育10-30min,所述沉淀物与第二缓冲液的质量比为1:2-50;然后加入胰蛋白酶在28-40℃的温度下酶解1-3h,然后再次加入胰蛋白酶在30-40℃的温度下酶解1-3h,接着加入甲酸或乙酸终止酶解,得到酶解液;
S5)前处理:将步骤S4得到的酶解液依次进行除盐和抽干处理,得到抽干肽段;
S6)检测:将步骤S5得到的抽干肽段复溶,然后进行LC-MS蛋白质谱检测。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述S1步骤中的纳米级分子筛为FAU、EMT、CHA、MOR、MFI、LTL、LTA和FER纳米分子筛中的一种或两种以上的组合,所述纳米分子筛的粒径为5~1000 nm。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述纳米分子筛的硅铝比为1:1-2000。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤S2中的第一缓冲液包括:0-50mmol/L的尿素、0-30mmol/L的Tris-HCl、0-200mmol/L的柠檬酸钠、1-10mmol/L的EDTA、100-300mmol/L的KCl、100-500mmol/L的NaCl、以及按照重量百分数计0-5% 的CHAPS、余量为质谱级水,所述第一缓冲液的pH值=6-8。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述纳米分子筛的硅铝比为1:1-2000。
6.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤S4中采用在离心力5000-10000g的情况下离心5-20min。
7.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤S4中的第二缓冲液包括按摩尔体积比计的10-400mmol/L的DTT、10-40 mmol/L的IAA,以及水和NH4HCO3,所述水的质量为m1,所述NH4HCO3的重量为m2,m1:m2:=90-99::1-10,所述第二缓冲液的pH值=7-9。
8.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤S4中,对沉淀物加入第二缓冲液后震荡孵育后、在加入胰蛋白酶进行酶解前,对沉淀物中的蛋白质含量进行检测。
9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于,在步骤S4中,进行酶解所加入的胰蛋白酶与沉淀物中的蛋白质的重量比为1:30-100。
10.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述步骤S5中采用C18柱对酶解液进行除盐处理。
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