[发明专利]与鉴定母猪杀婴行为相关的SNP分子标记及其在遗传育种中的应用

说明书

本发明公开了与鉴定母猪杀婴行为频率相关的SNP分子标记及其在遗传育种中的应用。本发明所要解决的问题是如何鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为的频率。本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，尤其涉及与鉴定母猪杀婴行为相关的SNP分子标记及其在遗传育种中的应用。该SNP为猪3号染色体上的一个位点，其核苷酸种类为T或C，为序列表中序列3的第89位核苷酸。该SNP的基因型为TT或CC的待测母猪个体发生杀婴行为的频率低于或候选低于基因型为TC的待测猪。本发明可用于辅助鉴定母猪杀婴行为的频率，可以对猪品种进行早期筛选，提高仔猪存活率，可与其他的母猪杀婴行为频率相关的分子标记结合辅助进行猪育种。

技术领域

本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，尤其涉及与鉴定母猪杀婴行为相关的SNP分子标记及其在遗传育种中的应用。

背景技术

母猪母性行为的好坏对仔猪的存活、生长发育及福利都有着重要的影响。母猪杀婴行为是指母猪在分娩期间或仔猪出生后24小时之内咬伤甚至咬死新生仔猪的行为，也被称为母猪的咬仔行为。母猪的这种异常行为是极端恶劣的母性行为。有研究报道，商业母猪群体中，母猪的杀婴行为频率达到7-12％，初产母猪发生频率更高，对生产造成重大损失。

母猪杀婴行为受到神经和内分泌的调控。大脑的神经系统调控激素分泌，从而调控行为的发生。YWHAG基因被研究报道通在大脑中高度表达，调节多种细胞信号通路。并发现该基因的突变导致发育性脑病、癫痫疾病和发育迟缓或退化的发生。因此我们对母猪YWHAG基因与母猪母性行为进行关联研究，并发现显著关联位点，通过利用分子生物学手段，为早期鉴定母猪杀婴行为提供有效手段。

发明内容

本发明所要解决的问题是如何鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为的频率。

为了解决以上技术问题，本发明首先提供了检测猪基因组中SNP的多态性或基因型的物质的应用。

本发明所提供的应用为检测猪基因组中SNP的多态性或基因型的物质在如下任一种中的应用，

(1)检测与母猪杀婴行为频率相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；

(2)鉴定或辅助鉴定与母猪杀婴行为频率相关的产品；

(3)用于猪育种的产品；

(4)制备鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的产品；

(5)制备筛选或选育母猪杀婴行为频率低的猪品种的产品；

所述SNP为猪3号染色体上的一个位点，其核苷酸种类为T或C，为序列表中序列3的第89位核苷酸。

以猪基因组序列(10.2版本(http://asia.ensembl.org/Sus_scrofa/Info/Index))为参考基因组，所述SNP为猪3号染色体上9907599bp处(具体为序列表中序列3第89位)。

本发明还提供了鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的方法。

本发明所提供的鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的方法包括检测待测猪基因组中前文所述SNP的基因型，根据所述待测猪的所述SNP的基因型鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率高低：所述SNP为猪3号染色体上的一个位点，其核苷酸种类为T或C，为序列表中序列3的第89位核苷酸；基因型为TT、TC或CC，所述基因型TT是所述SNP为T的纯合型，所述基因型CC是所述SNP为C的纯合型，所述基因型TC是所述SNP为T和C的杂合型；

所述鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的方法具体为如下：

1)前文所述SNP的基因型为TT或CC的待测猪为或候选为母猪杀婴行为频率低的猪品种；

2)前文所述SNP的基因型为TC的待测猪为或候选为母猪杀婴行为频率高的猪品种；