[发明专利]与鉴定母猪杀婴行为相关的SNP分子标记及其在遗传育种中的应用

权利要求书

1.检测猪基因组中SNP的多态性或基因型的物质在如下任一种中的应用：

(1)检测与母猪杀婴行为频率相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；

(2)鉴定或辅助鉴定与母猪杀婴行为频率相关的产品；

(3)用于猪育种的产品；

(4)制备鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的产品；

(5)制备筛选或选育母猪杀婴行为频率低的猪品种的产品；

所述SNP为猪3号染色体上的一个位点，其核苷酸种类为T或C，为序列表中序列3的第89位核苷酸。

2.鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的方法，其特征在于：包括检测待测猪基因组中权利要求1中所述SNP的基因型，根据所述待测猪的所述SNP的基因型鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率高低：所述SNP为猪3号染色体上的一个位点，其核苷酸种类为T或C，为序列表中序列3的第89位核苷酸；基因型为TT、TC或CC，所述基因型TT是所述SNP为T的纯合型，所述基因型CC是所述SNP为C的纯合型，所述基因型TC是所述SNP为T和C的杂合型；

所述鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率高低的方法具体为如下：

1)权利要求1中所述SNP的基因型为TT或CC的待测猪为或候选为母猪杀婴行为频率低的猪品种；

2)权利要求1中所述SNP的基因型为TC的待测猪为或候选为母猪杀婴行为频率高的猪品种；

3)权利要求1中所述SNP的基因型为TT或CC的待测母猪个体发生杀婴行为的频率低于或候选低于所述SNP的基因型为TC的待测猪。

3.权利要求2所述的方法在猪育种中的应用。

4.猪育种的方法，其特征在于：所述方法包括检测猪基因组中权利要求1中所述SNP位点的基因型，选择所述SNP的基因型为TT或CC的猪作为亲本进行育种，所述TT基因型是所述SNP为T的纯合型，所述CC基因型是所述SNP为C的纯合型，所述方法的育种目的包括选育母猪杀婴行为频率低的猪。

5.根据权利要求1或3所述的应用、权利要求2或4中所述的方法，其特征在于：所述猪育种为培育母猪杀婴行为频率低的猪品种。

6.产品，其特征在于：所述产品为含有权利要求1中所述检测猪基因组SNP的多态性或基因型的物质的产品，且可为下述G1)-G5)中的任一种：

G1)检测母猪杀婴行为频率相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；

G2)鉴定或辅助鉴定母猪杀婴行为频率的产品；

G3)用于猪育种的产品；

C4)筛选或选育母猪杀婴行为频率低的猪品种的产品；

C5)制备筛选或选育母猪杀婴行为频率低的猪品种的产品。

7.根据权利要求1所述的应用或权利要求6所述的产品，其特征在于：所述物质为如下D1)、D2)或D3)：

D1)所述物质为扩增包含权利要求1所述SNP的猪基因组DNA片段的引物组合物；

D2)所述物质为含有D1)所述引物组合物的PCR试剂；

D3)所述物质为含有D1)所述引物组合物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。

8.根据权利要求7所述的应用或产品，其特征在于：所述引物组合物由引物U和引物D组成；所述引物U为核苷酸序列是序列表中序列1的单链DNA分子；所述引物D为核苷酸序列是序列表中序列2的单链DNA分子。

9.DNA分子，其特征在于：所述DNA分子的核苷酸序列是序列表中的序列3。

10.用于母猪杀婴行为频率筛查的设备，包括：

测序装置，所述测序装置用于对待测猪的基因组中包括权利要求1所述SNP的DNA片段进行测序，获得测序结果；

比对装置，所述比对装置与所述测序装置相连，且用于基于所述测序结果，确定所述SNP的基因型；

分析装置，所述分析装置与所述比对装置相连，且用于基于所述基因型确定母猪杀婴行为的频率。