[发明专利]一种新型多靶点胃癌检测的标志物组合及其应用

说明书

本发明提供了一种新型多靶点胃癌检测的组合标志物及其应用，通过从胃癌组织、癌旁组织、胃炎患者样本的高深度全基因组甲基化(WGBS)数据中找到了系列新型的、能高效区分胃癌和胃炎患者的甲基化位点，可用于胃癌的高效检测；将该新型基因甲基化位点与其他胃癌检测标志物(如PGI、PGII、G17和CEA)组合，能进一步提高AUC值，提高胃癌筛查的灵敏度和特异性。

技术领域

本发明涉及癌症筛查领域，具体而言，涉及一种新型多靶点胃癌检测的标志物组合及其应用。

背景技术

临床常用的胃癌诊断方案为内镜和影像学检查。但胃癌在一般人群中发病率较低(33/10万)，若将胃镜用于胃癌普查，则需消耗大量人力、物力资源，且由于其具有侵入性，患者的接受程度普遍较低。因此，内镜检查应用于胃癌早期筛查具有一定的局限性。影像学虽有多种检测手段，但一般也只用于定位和分期诊断。CT对进展期胃癌诊断率为65％～90％，早期胃癌仅约50％，在胃癌初诊时，并不推荐使用CT作为首选方案。传统的血清肿瘤标志物(CEA、CA19-9和CA72-4等)在胃癌诊断中的特异性维持在85.1％～96.2％时，其灵敏性不足27.6％。此外，PG、G-17和H.pylori等检测对胃癌诊断也存在较大争议。作为胃癌诊断金标准的内镜下活检则不仅有很大的侵入性，且有引起肿瘤扩散的风险。不仅如此，由于肿瘤有普遍的肿瘤内异质性存在，导致很多时候穿刺活检并不能显示肿瘤的全貌。目前临床常用的诊断方案虽然在胃癌定性、定位和分期方面具有一定的诊断能力，但是这些诊断方法在早期诊断方面的性能略显不足。

基于循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA，ctDNA)检测的液体活检技术，由于其无创、实时、灵敏的特点，使之成为癌症早筛的主要检测方法，其中ctDNA的甲基化指标凭借组织溯源、增强信噪比、特征位点数量多等优势是癌症早筛的理想标志物。Kandimalla等(Clinical Cancer Research 27.22(2021):6135-6144)对多种胃肠道癌症进行了全基因组DNA甲基化分析，通过癌组织和非癌组织的比较，获得大量的差异甲基化区域(differentially methylated regions，DMRs)。基于这些DMRs结合机器学习算法，开发了胃肠道相关癌症的Panel，整体检测的AUC值为0.88，该研究提示ctDNA甲基化检测在胃肠道癌症检测中具有可靠的诊断准确性。Miao等(Cancer Control 27.2(2020):1073274820922559)比较了血浆甲基化SFRP2和肿瘤标志物(CEA、CA72-4、CA19-9和CA242)的胃癌诊断能力，结果显示甲基化SFRP2的检测灵敏度为60.9％，特异性为86％，显著优于肿瘤标志物的灵敏度(11.4％-22.8％)，可作为一种潜在的早期胃癌筛查生物标志物。但是现有的甲基化位点的检测早期胃癌的AUC值普遍偏低，灵敏度和特异性不高，并不能很好地区分胃癌和胃炎患者，依然还需要通过进一步地检查才能确诊。