[发明专利]一种基于特异探针及SNP位点的牛布鲁氏杆菌鉴定方法在审

专利信息
申请号: 202310060853.3 申请日: 2023-01-19
公开(公告)号: CN115948587A 公开(公告)日: 2023-04-11
发明(设计)人: 刘先凯;吕宇飞;王恒樑;王东澍;袁璐;朱力;潘超;郭艳 申请(专利权)人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 100850 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 特异 探针 snp 牛布鲁氏 杆菌 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.鉴定或辅助鉴定牛布鲁氏杆菌的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:

S1)、提取待测样品的基因组DNA;

S2)、对所述基因组DNA进行测序,得到测序结果;

S3)、将所述测序结果与鉴定牛布鲁氏杆菌的特异性探针进行序列比对,根据序列比对结果确定或辅助确定待测样品是否为牛布鲁氏杆菌或是否含有牛布鲁氏杆菌;

如果序列比对结果表明待测样品的基因组DNA序列中含有所述特异性探针中任一种探针,该待测样品为牛布鲁氏杆菌或含有牛布鲁氏杆菌;如果序列比对结果表明待测样品的基因组DNA序列中不含有所述特异性探针,该待测样品为非牛布鲁氏杆菌或不含有牛布鲁氏杆菌;

所述特异性探针包含名称为探针1至探针28的28种单链DNA至少一种:

探针1含有SNP(单核苷酸多态性)位点1,所述SNP位点1为序列1的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针2含有SNP(单核苷酸多态性)位点2,所述SNP位点2为序列2的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针3含有SNP(单核苷酸多态性)位点3,所述SNP位点3为序列3的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针4含有SNP(单核苷酸多态性)位点4,所述SNP位点4为序列4的第100位核苷酸且该核苷酸为A;

探针5含有SNP(单核苷酸多态性)位点5,所述SNP位点5为序列5的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针6含有SNP(单核苷酸多态性)位点6,所述SNP位点6为序列6的第92位核苷酸且该核苷酸为C;

探针7含有SNP(单核苷酸多态性)位点7,所述SNP位点7为序列7的第63位核苷酸且该核苷酸为C;

探针8含有SNP(单核苷酸多态性)位点8,所述SNP位点8为序列8的第100位核苷酸且该核苷酸为C;

探针9含有SNP(单核苷酸多态性)位点9,所述SNP位点9为序列9的第68位核苷酸且该核苷酸为A;

探针10含有SNP(单核苷酸多态性)位点10,所述SNP位点10为序列10的第79位核苷酸且该核苷酸为A;

探针11含有SNP(单核苷酸多态性)位点11,所述SNP位点11为序列11的第74位核苷酸且该核苷酸为C;

探针12含有SNP(单核苷酸多态性)位点12,所述SNP位点12为序列12的第87位核苷酸且该核苷酸为T;

探针13含有SNP(单核苷酸多态性)位点13,所述SNP位点13为序列13的第63位核苷酸且该核苷酸为G,所述SNP位点14为序列13的第64位核苷酸且该核苷酸为C;

探针14含有SNP(单核苷酸多态性)位点15,所述SNP位点15为序列14的第100位核苷酸且该核苷酸为G;

探针15含有SNP(单核苷酸多态性)位点16,所述SNP位点16为序列15的第69位核苷酸且该核苷酸为A;

探针16含有SNP(单核苷酸多态性)位点17,所述SNP位点17为序列16的第20位核苷酸且该核苷酸为C;所述SNP位点18为序列16的第151位核苷酸且该核苷酸为G;

探针17含有SNP(单核苷酸多态性)位点19,所述SNP位点19为序列17的第81位核苷酸且该核苷酸为T;

探针18含有SNP(单核苷酸多态性)位点20,所述SNP位点20为序列18的第90位核苷酸且该核苷酸为A;

探针19含有SNP(单核苷酸多态性)位点21,所述SNP位点21为序列19的第99位核苷酸且该核苷酸为A;

探针20含有SNP(单核苷酸多态性)位点22,所述SNP位点22为序列20的第92位核苷酸且该核苷酸为T;

探针21含有SNP(单核苷酸多态性)位点23,所述SNP位点23为序列21的第71位核苷酸且该核苷酸为A;

探针22含有SNP(单核苷酸多态性)位点24,所述SNP位点24为序列22的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针23含有SNP(单核苷酸多态性)位点25,所述SNP位点25为序列23的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针24含有SNP(单核苷酸多态性)位点26,所述SNP位点26为序列24的第58位核苷酸且该核苷酸为T;

探针25含有SNP(单核苷酸多态性)位点27,所述SNP位点27为序列25的第100位核苷酸且该核苷酸为A,所述SNP位点28为序列25的第136位核苷酸且该核苷酸为T;

探针26含有SNP(单核苷酸多态性)位点29,所述SNP位点29为序列26的第78位核苷酸且该核苷酸为T;

探针27含有SNP(单核苷酸多态性)位点30,所述SNP位点30为序列27的第100位核苷酸且该核苷酸为T;

探针28含有SNP(单核苷酸多态性)位点31,所述SNP位点31为序列28的第69位核苷酸且该核苷酸为T。

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