[发明专利]一种用于检测和鉴别布鲁氏杆菌的试剂盒与检测方法在审
申请号: | 202310045345.8 | 申请日: | 2023-01-30 |
公开(公告)号: | CN116004870A | 公开(公告)日: | 2023-04-25 |
发明(设计)人: | 王国俊;李学洋;韩琪;李怀珠;柯欣;张乾义 | 申请(专利权)人: | 内蒙古大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12N15/11;C12N15/113;C12Q1/6844;C12R1/01 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 孙振家 |
地址: | 010070 内蒙古*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 鉴别 布鲁氏 杆菌 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测和鉴别布鲁氏杆菌的crRNA,其特征在于,所述crRNA为crRNA-Me、crRNA-Ab和crRNA-Su的组合;
所述crRNA-Me的序列如SEQ ID NO.1所示;所述crRNA-Ab的序列如SEQ ID NO.2所示;所述crRNA-Su的序列如SEQ ID NO.3所示。
2.一种用于检测和鉴别布鲁氏杆菌的crDNA,其特征在于,所述crDNA为crDNA-Me、crDNA-Ab和crDNA-Su的组合;
所述crDNA-Me的序列如SEQ ID NO.4所示;所述crDNA-Ab的序列如SEQ ID NO.5所示;所述crDNA-Su的序列如SEQ ID NO.6所示。
3.一种用于检测和鉴别布鲁氏杆菌的DNA,其特征在于,所述DNA为DNA-Me、DNA-Ab和DNA-Su的组合;
所述DNA-Me的序列如SEQ ID NO.7所示;所述DNA-Ab的序列如SEQ ID NO.8所示;所述DNA-Su的序列如SEQ ID NO.9所示。
4.一种用于检测和鉴别布鲁氏杆菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的crRNA或权利要求2所述的crDNA。
5.如权利要求4所述的用于检测布鲁氏杆菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Cas蛋白和荧光探针;所述Cas蛋白为CRISPR-Cas13蛋白。
6.如权利要求5所述的用于检测布鲁氏杆菌的试剂盒,其特征在于,所述荧光探针序列的5端标记有荧光基团,3端标记有淬灭基团;所述荧光基团为FAM;淬灭基团为BHQ1;
进一步优选的,所述荧光探针为ssRNA荧光探针,序列为5’-FAM-UUUUU-3’BHQ1。
7.一种利用权利要求4所述试剂盒以非诊断目的检测和鉴别布鲁氏杆菌的方法,其特征在于,包括步骤如下:
(1)提取待测样本的基因组;
(2)以提取的待测样本基因组为模板,加入至含有反应液和聚合酶的反应体系中,进行RPA扩增;
(3)取RPA扩增产物分别建立Me检测体系、Ab检测体系和Su检测体系,在37℃下,孵育5~30min;
(4)将Me检测体系、Ab检测体系和Su检测体系分别放入LED照射灯下,当Me检测体系荧光显色时,表明待测样本是羊种布鲁氏杆菌菌株;当Ab检测体系荧光显色时,表明待测样本是牛种布鲁氏杆菌菌株;当Su检测体系荧光显色时,表明待测样本是猪种布鲁氏杆菌菌株;当三个反应体系同时不形成荧光显示时,表明待测样本不存在牛、羊和猪种布鲁氏杆菌感染。
8.如权利要求7所述的检测和鉴别布鲁氏杆菌的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述待测样本为经过65~80℃、10分钟预灭活处理的羊、牛和猪的全血、尿液或唾液。
9.如权利要求7所述的检测和鉴别布鲁氏杆菌的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述RPA扩增的引物序列为:
正向引物:
5'-GAAATTAATACGACTCACTATAGGGCCGTATGGTTCAGCCGCACAATTTCGGAA T-3';
反向引物:5'-AACCGGTCATCTGGCAGGGGCAGGCCTTGG-3';
所述RPA扩增体系为:RPA基础反应球一管,再水合缓冲液29.5μL,醋酸镁缓冲液2.5μL,正向引物2.5μL,反向引物2.5μL,其余用无酶水8μL补足,然后进行5等份分配,每9μL一份,每份加待测样本1μL,总体积10μL;
扩增条件为:反应温度39~42℃,孵育时间5~20min。
10.如权利要求7所述的检测和鉴别布鲁氏杆菌的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述Me检测体系、Ab检测体系和Su检测体系相同,具体为:Tris-HCl 400mM、MgCl2 120mM、ssRNA荧光探针2μM、crRNA 0.5μL、RNase Inhibitor 0.5μL、Cas13a蛋白2μL、T7 Polymerase0.25μL、rNTP 0.4μL,RPA扩增产物1μL,总体积10μL。
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